| 基于全基因组分析2017—2021年福建省猪繁殖与呼吸综合征病毒基因组特征 |
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| 引用本文： | 刘建奎,徐叶,刘辰,于慧,杨圆,何乐,李佳睿,但惠娟,戴爱玲,杨小燕,魏春华.基于全基因组分析2017—2021年福建省猪繁殖与呼吸综合征病毒基因组特征[J].畜牧兽医学报,2023(4):1579-1589. |
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| 作者姓名： | 刘建奎 徐叶 刘辰 于慧 杨圆 何乐 李佳睿 但惠娟 戴爱玲 杨小燕 魏春华 |
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| 作者单位： | 1. 龙岩学院生命科学学院;2. 福建省家畜传染病防治与生物技术重点实验室;3. 福建农林大学动物科技学院 |
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| 摘 要： | 通过对福建地区规模化猪场猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV)进行病毒分离及全基因组序列分析，从而了解PRRSV流行情况及基因组特征，为猪场防控PRRS提供理论基础。2017—2021年从福建地区规模化猪场采集疑似感染PRRSV的组织病料和血清，进行病毒分离鉴定，采用RT-PCR方法对PRRSV分离株进行全基因组序列扩增，应用DNAstar 7.0软件进行序列分析，使用MEGA 7.0软件邻近法进行遗传演化分析，并利用生物软件SimPlot 3.51和RDP4.10对PRRSV基因组序列进行重组分析。成功分离得到32株PRRSV-2,其全基因组大小为14 938～15 439 bp(不包括ployA),32株PRRSV之间基因组核苷酸相似性为82.4%～99.4%,与PRRSV-2代表毒株(VR-2332、JXA1、NADC30、QYYZ)和PRRSV-1代表毒株(LV)之间核苷酸相似性分别为81.4%～99%和59.8%～60.6%。分别基于PRRSV全基因组与ORF5基因构建的遗...
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| 关 键 词： | 猪繁殖与呼吸综合征病毒 病毒分离鉴定 全基因组 遗传变异 基因重组 |
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