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基于SNP芯片对陆川猪进行遗传多样性与遗传结构分析的研究
引用本文:周隽,覃星文,吴细波,覃燕灵,吴先华,肖有恩,张宁,韦明宇,司景磊.基于SNP芯片对陆川猪进行遗传多样性与遗传结构分析的研究[J].中国畜牧杂志,2023(8):257-263.
作者姓名:周隽  覃星文  吴细波  覃燕灵  吴先华  肖有恩  张宁  韦明宇  司景磊
作者单位:1. 广西农垦永新畜牧集团有限公司良圻原种猪场;2. 广西农垦永新畜牧集团新兴有限公司;3. 广西农垦永新畜牧集团有限公司;5. 广西大学动物科学技术学院
摘    要:陆川猪是我国优良的地方品种,但由于非洲猪瘟的影响导致其养殖量急剧下降,对其进行种质资源保护刻不容缓。本研究旨在通过SNP芯片分析陆川猪遗传结构和遗传多样性,为该群体后续保种策略提供一定的参考。本研究基于269头能繁公母猪SNP芯片信息,分析该群体遗传结构、亲缘关系、家系划分以及近交系数。结果显示,该群体部分个体遗传关系较近,IBS遗传距离在0.09~0.31,平均值为0.25;通过聚类分析和G矩阵结果,将269头陆川猪分为3个家系,分别有9、3、6头公猪,母猪在家系间存在交叉;ROH分析发现该群体平均ROH长度为(503.77±8.89)Mb,主要分布在388~475 Mb,FROH主要分布在0.13~0.23,其平均FROH为0.21±0.004。研究表明,该群体陆川猪家系较少,ROH数量多且较长,近交风险较大,急需引入外源血统丰富其遗传多样性,并根据芯片结果,合理规划配种策略,降低群体近交水平。

关 键 词:陆川猪  SNP芯片  遗传结构  近交系数
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