| 杜洛克猪生长性状全基因组关联分析及候选基因鉴定 |
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| 引用本文： | 张笑科,廖伟莉,陈信佑,李婷婷,袁晓龙,李加琪,黄翔,张豪.杜洛克猪生长性状全基因组关联分析及候选基因鉴定[J].畜牧兽医学报,2023(5):1868-1876. |
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| 作者姓名： | 张笑科 廖伟莉 陈信佑 李婷婷 袁晓龙 李加琪 黄翔 张豪 |
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| 作者单位： | 1. 华南农业大学动物科学学院广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室国家生猪种业工程技术研究中心 |
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| 基金项目： | 广东省重点领域研发计划(2022B0202090002)；;国家生猪产业技术体系(CARS-35)； |
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| 摘 要： | 旨在对杜洛克猪生长性状进行全基因组关联分析及候选基因鉴定。本研究选用361头杜洛克种公猪作为试验群体，对达100 kg体重日龄、达100 kg平均日增重、达100 kg活体背膘厚和达100 kg眼肌面积性状进行测定，基因型信息使用50K单核苷酸多态性阵列进行分型，质控后得到31 618个SNPs。使用GCTA软件利用基因组信息对各生长性状进行遗传参数估计，使用R软件rMVP包FarmCPU模型进行全基因组关联分析，鉴定与生长性状相关的基因组区域和候选基因。结果表明，达100 kg体重日龄、达100 kg平均日增重、达100 kg活体背膘厚和达100 kg眼肌面积性状的遗传力分别为0.27、0.29、0.16和0.11,属于中等遗传力性状，达100 kg体重日龄和达100 kg平均日增重的遗传相关和表型相关值均为-0.99,为强负相关关系。全基因关联分析结果表明，在达100 kg体重日龄和达100 kg平均日增重性状上共检测到3个显著SNPs,均位于10号染色体上。使用最小显著差数检验法对显著SNPs的等位基因型进行多重比较，显著SNPs rs81237156、rs81424502和rs...
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| 关 键 词： | 猪 生长性状 全基因组关联分析 候选基因 FarmCPU |
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