碱地黑牛FADS1基因克隆测序及表达分析 |
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引用本文: | 陈振鹏,刘瑞莉,王胜,韩明轩,于堃,张文琦,柏学进,董雅娟.碱地黑牛FADS1基因克隆测序及表达分析[J].中国畜牧杂志,2023(5):92-98. |
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作者姓名: | 陈振鹏 刘瑞莉 王胜 韩明轩 于堃 张文琦 柏学进 董雅娟 |
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作者单位: | 1. 青岛农业大学动物科技学院;3. 山东胜伟牧业有限公司 |
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摘 要: | 实验旨在研究碱地黑牛脂肪酸脱氢酶1基因(FADS1)CDS区序列和表达情况,并探讨FADS1基因理化性质及表达规律。本研究通过克隆测序构建FADS1的系统进化树并进行生物信息学分析,用免疫组化技术对FADS1蛋白进行定位分析,免疫印迹检测FADS1蛋白在实验组织的表达情况。生物信息学结果显示碱地黑牛FADS1 CDS区长1 083 bp,编码360个氨基酸。FADS1不存在信号肽。FADS1进化树显示碱地黑牛FADS1与牛的遗传距离较近(99.9%),与鸡的遗传距离较远(80.0%)。结构预测表明FADS1中α螺旋占48.61%,β折叠占3.61%,延长链占13.06%,无规则卷曲占34.72%,4个α螺旋构成四螺旋束并在螺旋肽段之间形成一个疏水性的空腔,整体呈中空的桶状。互作网络解析显示:FADS1与ACSL1、ACSL3、ELOVL2、ELOVL5、PTPLA、PTPLB、ACOX1、ACOX2、ACADM、FASN、TECR等蛋白互作,参与FADS1-ELOVL5-HSD17B12-ACADM-ACOX1、FADS1-FASN-ACADVL-ACOX2等脂肪酸合成、代谢、脂滴生成...
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关 键 词: | FADS1基因 生物信息学 碱地黑牛 免疫组化 免疫印迹 |
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