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鹅星状病毒基因Ⅰ型和Ⅱ型双重荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用
引用本文:王宏宇,朱寅初,云涛,张存,鲍恩东.鹅星状病毒基因Ⅰ型和Ⅱ型双重荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用[J].畜牧兽医学报,2023(4):1616-1623.
作者姓名:王宏宇  朱寅初  云涛  张存  鲍恩东
作者单位:1. 南京农业大学动物医学院;2. 浙江省农业科学院畜牧兽医研究所
基金项目:浙江省自然科学基金资助项目(LGN22C180005);;浙江省重点研发计划项目(2019C02052);;江苏省农业科技自主创新资金项目(CX(22)2016);
摘    要:鹅星状病毒(goose astroviruses, GAstV)作为一种雏鹅新发病原,对养鹅业造成巨大经济损失,在尚无有效治疗手段情况下,加强疫病及时检测和防控十分重要。为建立快速、特异且灵敏的鉴别GAstVⅠ型和GAstVⅡ型的病毒检测方法,本研究根据GAstVⅠ和GAstVⅡ的保守区域RdRp基因序列,设计合成2对特异性引物和2种不同荧光基团标记的TaqMan探针,建立了一种双重荧光定量PCR检测方法,以达到在同一反应体系中同时定量检测GAstVⅠ和GAstVⅡ的目的。结果显示,GAstVⅠ和GAstVⅡ的最小检出量分别为43.3、6.49 copies·μL-1;重复试验的变异系数不超过0.5%;该方法对DPV、GPV、GTMUV、GRV、AIV(H9N2)等病毒核酸无交叉反应。综上表明,本研究建立的可鉴别GAstVⅠ和GAstVⅡ的双重荧光定量PCR方法灵敏度高、特异性强、重复性好。可用于临床GAstVⅠ和GAstVⅡ的快速鉴别诊断,也可用于两种基因型GAstV的定量分析。

关 键 词:鹅星状病毒Ⅰ型  鹅星状病毒Ⅱ型  双重荧光定量RT-PCR  TaqMan探针
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