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皖南黑猪不同生长阶段血清免疫指标及肠道菌群的特征分析
引用本文:郑先瑞,卓明雪,纪金丽,蒋维虎,邓在双,张吉成,田雅莉,丁月云,张晓东,殷宗俊.皖南黑猪不同生长阶段血清免疫指标及肠道菌群的特征分析[J].畜牧兽医学报,2023(9):3770-3783.
作者姓名:郑先瑞  卓明雪  纪金丽  蒋维虎  邓在双  张吉成  田雅莉  丁月云  张晓东  殷宗俊
作者单位:1. 安徽农业大学动物科技学院;2. 地方畜禽遗传资源保护与生物育种安徽省重点实验室
基金项目:安徽省科技重大专项(202103a06020013);;国家自然科学基金(31972531);;国家重点研发计划(2021YFD1301200);
摘    要:旨在探究皖南黑猪不同生长阶段粪便菌群和血清免疫指标的纵向变化规律及其相关性。采集27头皖南黑猪哺乳期(20 d)、保育期(60 d)和育肥期(120 d)3个不同生长阶段的粪便及血清样本,通过16S rRNA高通量测序方法及血清检测技术,对皖南黑猪生长发育过程中肠道微生物与免疫指标的演替规律及关联性进行了分析。结果表明,肠道微生物物种丰度分析显示,在门水平上共检测到22个核心菌门,其中厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)是皖南黑猪的主要优势菌门;在属水平上检测到51个核心菌属,其中哺乳期的优势菌属为乳酸菌属(Lactobacillus)、志贺菌属(Shigella)和粪杆菌属(Faecalibacterium)。保育期和育肥期均以乳酸杆菌属(Lactobacillus)、颤螺菌属(Oscillospira)和密螺旋体属(Treponema)为优势菌属;Alpha多样性分析显示,皖南黑猪肠道菌群的多样性随日龄增长呈逐渐增高的趋势,在保育期达到峰值,育肥期逐渐趋向稳定。Beta多样性分析显示,皖南黑猪保育期及育肥期肠道菌群组成相似聚在一起,而与哺乳期肠道...

关 键 词:猪肠道微生物  动态变化  16S  rRNA  生长阶段和性能  血清免疫指标
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