| 黄鳍鲷肌肉中弹性蛋白酶基因全长克隆及生物信息学 |
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| 引用本文： | 钟婵,吴国平,舒梅,孙乐常,曹敏杰.黄鳍鲷肌肉中弹性蛋白酶基因全长克隆及生物信息学[J].水产学报,2021,45(1):125-135. |
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| 作者姓名： | 钟婵 吴国平 舒梅 孙乐常 曹敏杰 |
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| 作者单位： | 江西农业大学,江西农业大学,江西农业大学,集美大学,集美大学 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（31701676，31760483）；江西省自然科学基金（20192BAB214026）；江西省教育厅科技计划重点项目（GJJ180173） |
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| 摘 要： | 研究表明弹性蛋白酶(elastase, Ela)参与调控嗜水气单胞菌引起的细菌性溃疡病,对控制鱼类养殖中免疫疾病有重要作用。本研究根据已报道脊椎动物的Elas基因序列设计特异性引物,通过RT-PCR和RACE技术克隆获得黄鳍鲷Ela基因(AlEla)cDNA序列全长,并对其进行生物信息学分析。结果显示,AlEla基因全长为946 bp,包含807 bp的开放阅读框,编码269个氨基酸,含有16个氨基酸信号肽的亲水性稳定膜外蛋白,定位于细胞外基质,具有3个O-糖基化和15个磷酸化的潜在位点。编码的成熟AlEla蛋白预测相对分子质量27 509 u,等电点为6.05。氨基酸序列同源性比对发现,AlEla与鲷和鲆的Elas2的同源性为84.76%～99.26%,处于系统进化树上同一分支,表明它们的亲缘性相近。AlEla具有Elas的保守结构,如Tryp-SPc结构域、丝氨酸蛋白酶催化三联体、保守的半胱氨酸残基以及在C端含有GDSGGPL序列等,揭示该酶有丝氨酸蛋白酶的催化活性。对AlEla蛋白的二级结构分析显示,α-螺旋、β-转角、β-折叠和无规则卷曲所占的比例分别为17.84%、7.06%、24.54%和50.56%。三级结构分析推测α-螺旋和β-折叠对于AlEla蛋白的空间构象可能有着重要作用。本研究从黄鳍鲷肌肉中成功克隆AlEla基因并分析其生物信息学特征,为后续研究AlEla参与调控鱼类免疫疾病的机制提供理论基础。
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| 关 键 词： | 黄鳍鲷 弹性蛋白酶 基因克隆 生物信息学分析 |
| 收稿时间： | 2019/11/23 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2020/6/23 0:00:00 |
Cloning and bioinformatic analysis of elastase gene from skeletal muscle of yellowfin seabream (Acanthopagrus latus) |
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| ZHONG Chan,WU Guoping,SHU Mei,SUN Lechang,CAO Minjie.Cloning and bioinformatic analysis of elastase gene from skeletal muscle of yellowfin seabream (Acanthopagrus latus)[J].Journal of Fisheries of China,2021,45(1):125-135. |
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| Authors: | ZHONG Chan WU Guoping SHU Mei SUN Lechang CAO Minjie |
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| Institution: | Jiangxi Agricultural University,Jiangxi Agricultural University,Jiangxi Agricultural University,Jimei University,Jimei University |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Acanthopagrus latus elastase gene cloning bioinformatic analysis |
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