| TLR9基因SNP位点检测及其在7种鲤中的遗传多样性研究 |
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| 引用本文： | 柏盈盈,贾智英,葛会争,李池陶,张秋军,石连玉.TLR9基因SNP位点检测及其在7种鲤中的遗传多样性研究[J].淡水渔业,2013(6):19-28. |
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| 作者姓名： | 柏盈盈 贾智英 葛会争 李池陶 张秋军 石连玉 |
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| 作者单位： | 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所;上海海洋大学水产与生命学院 |
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| 基金项目： | 国家“863”计划(2011AA100402);公益性行业(农业)科研专项(200903045);黑龙江省自然科学基金项目(C201044);黑龙江省科技攻关项目(GZ11B203);现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-46-02);国家科技支撑计划(2012BAD26B01) |
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| 摘 要： | 采用直接测序法对7种鲤(Cyprinus carpio):德国镜鲤(C.carpio L.mirror)、松荷鲤(C.carpio L)、松浦鲤(C.carpio var.Songpu)、易捕鲤(C.carpio var.Yibu)、大头鲤(C.pellegrini T.)、松浦镜鲤(C.carpio var.Songpu mirror)和野鲤(C.carpio haematoperus)TLR9基因的SNP位点的多态性和遗传多样性进行了研究。结果显示,在292个个体中共检测出37个碱基变异位点,均位于基因外显子区域,占整个片段长度的0.84%,其中20个SNP位点为非同义突变。野鲤的碱基突变位点最多,松浦镜鲤的碱基突变位点最少(P<0.05),其他各品种间无显著性差异(P>0.05);野鲤的非同义突变位点最多,松浦镜鲤的非同义突变位点最少(P<0.05),其他各品种间无显著性差异(P>0.05)。稀有等位基因频率大于0.05时,经Hardy-Weinberg卡方检验结果显示各品种中除了德国镜鲤和松浦镜鲤外,大多数位点都处于平衡状态(P>0.05);各品种的PIC值处于中低度多态水平(PIC<0.5)。卡方检验分析结果显示,各品种间共有24个位点的基因型频率存在显著性差异(P<0.05),其中11个位点为非同义突变位点,这可能是影响TLR9基因免疫应答功能的原因。
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| 关 键 词： | TLR9基因 SNP 鲤(Cyprinus carpio) 遗传多样性 |
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