| 沙田柚乙烯应答因子的鉴定和生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 李璐璐,陈玉梅,罗琼,李惠敏,秦新民.沙田柚乙烯应答因子的鉴定和生物信息学分析[J].江西农业学报,2018(9). |
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| 作者姓名： | 李璐璐 陈玉梅 罗琼 李惠敏 秦新民 |
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| 作者单位： | 广西师范大学生命科学学院 |
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| 摘 要： | 利用高通量测序对沙田柚自交和异交花柱进行转录组测序,通过差异分析得到了沙田柚乙烯应答因子基因序列。采用生物信息学方法,对其编码的蛋白质从序列特征、理化性质、跨膜结构域、高级结构以及功能域等方面进行了预测和分析。该基因全长为1013 bp(Gen Bank登录号为MG905213),开放阅读框(ORF)全长498 bp,编码的蛋白质含166个氨基酸。编码蛋白质的相对分子量为18.45 k Da,理论等电点为7.90。该蛋白质具有一个与AP2 superfamily蛋白相同的保守结构域,为亲水性非分泌不稳定蛋白,不属于跨膜运动,共有24个可能的磷酸化位点。氨基酸序列分析表明,该基因编码的蛋白质与芸香科的甜橙(Citrus sinensis,XP-006467696.1)和克莱门柚(Citrus clementina,XP-006449381.1)的AP2蛋白的同源性分别为100%和98%。系统进化树表明,沙田柚的乙烯应答转录因子与甜橙和克莱门柚亲缘关系很近,属于同一进化分支。
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