| 芒果SEPALLATA3基因的生物信息学与表达分析 |
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| 引用本文： | 谢小杰,余海霞,范志毅,黄方,刘源,莫啸,曾学梅,何新华,罗聪.芒果SEPALLATA3基因的生物信息学与表达分析[J].热带作物学报,2021,42(9):2487-2493. |
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| 作者姓名： | 谢小杰 余海霞 范志毅 黄方 刘源 莫啸 曾学梅 何新华 罗聪 |
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| 作者单位： | 广西大学农学院/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,广西南宁 530000 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31660561);国家自然科学基金项目(31860541);亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室自主研究课题(SKLCUSA-a201906) |
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| 摘 要： | SEPALLATA3（SEP3）属于MADS-box基因家族,与植物的成花时间和花器官分化有关。在本研究中,从芒果转录组数据中挖掘获得了2个MiSEP3s基因,分别命名为MiSEP3-1和MiSEP3-2。生物信息学分析显示,MiSEP3-1和MiSEP3-2基因的基因组DNA长度分别为4189 bp和3721 bp,2个基因的开放阅读框长度一致均为732 bp,编码244个氨基酸,蛋白质分子量分别为59.29 kD和59.28 kD。2个MiSEP3s的氨基酸序列中含有典型的MADS结构域和K-box结构域。启动子序列分析显示,2个MiSEP3s基因启动子均包含光响应元件、激素响应元件、逆境响应元件和转录因子结合位点,但调控元件种类和数量存在差异。基因表达模式分析显示,2个MiSEP3s基因在营养期的茎、叶和芽中表达量较低,但在成花转变后期的芽中持续上调表达,在花中达到表达高峰。该结果为MiSEP3基因功能的研究提供参考。
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| 关 键 词： | 芒果 SEPALLATA3 生物信息学 启动子 表达模式 |
| 收稿时间： | 2020-12-16 |
Bioinformatics and Expression Analysis of SEPALLATA3 in Mango |
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| XIE Xiaojie,YU Haixia,FAN Zhiyi,HUANG Fang,LIU Yuan,MO Xiao,ZENG Xuemei,HE Xinhua,LUO Cong.Bioinformatics and Expression Analysis of SEPALLATA3 in Mango[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2021,42(9):2487-2493. |
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| Authors: | XIE Xiaojie YU Haixia FAN Zhiyi HUANG Fang LIU Yuan MO Xiao ZENG Xuemei HE Xinhua LUO Cong |
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| Institution: | College of Agriculture, Guangxi University / State Key Laboratory of Protection and Utilization of Subtropical Agricultural Biological Resources, Nanning, Guangxi 530000, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | mango SEPALLATA3 bioinformatics promoter expression pattern |
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