香蕉TGA转录因子家族的鉴定及枯萎病菌胁迫下的表达分析 |
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引用本文: | 林萍,王明元,李雨晴,刘建福,张华英,林思锻.香蕉TGA转录因子家族的鉴定及枯萎病菌胁迫下的表达分析[J].热带作物学报,2021,42(8):2134-2142. |
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作者姓名: | 林萍 王明元 李雨晴 刘建福 张华英 林思锻 |
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作者单位: | 1.华侨大学园艺科学与工程研究中心/华侨大学生物工程与技术系,福建厦门 3610212.漳州市唯天生物科技有限公司,福建漳州 3639993.泉州市洛江区农业科学研究所,福建泉州 362011 |
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基金项目: | 福建省科技厅高校产学研重大项目(2017N5009);华侨大学中青年教师科研提升计划(ZQN-YX507);华侨大学研究生科研创新基金资助项目(18013087003) |
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摘 要: | 尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum f. sp. Cubense, Foc)引起的香蕉枯萎病是我国香蕉的主要病害之一,严重影响香蕉的产量和品质。TGA防御反应基因在香蕉应对尖孢镰刀菌胁迫的应答转录调控过程中至关重要。本研究以拟南芥TGA转录因子家族成员蛋白为查询序列,在香蕉基因组数据库中Blast筛选出TGA转录因子家族成员,并对该家族成员进行生物信息学分析。共鉴定得到9个香蕉TGA家族成员,分别命名为MaTGA1~MaTGA9;香蕉TGA家族蛋白富含酸性氨基酸,大部分蛋白以α螺旋为主;亚细胞定位主要在细胞核内。进化树分析表明,香蕉MaTGA转录因子家族的9个成员可分为Class Ⅰ和Class Ⅱ两类,基因结构及功能结构域的分布情况也呈现出高度一致。进一步通过RT-qPCR分析发现,MaTGA2、MaTGA3和MaTGA8在香蕉枯萎病菌侵染后的‘威廉斯’(易感病)及‘南天黄’(抗病)中均显著下调表达,MaTGA1、MaTGA6、MaTGA7和MaTGA9均呈现先下降后上升的趋势;然而MaTGA4和MaTGA5仅在‘威廉斯’中上调表达,以上结果表明MaTGA2、MaTGA3和MaTGA8在香蕉抗枯萎病中发挥重要的生物学功能。本研究结果为香蕉TGA转录因子功能挖掘奠定理论基础。
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关 键 词: | 香蕉 TGA转录因子 生物信息学分析 基因表达分析 |
收稿时间: | 2020-07-16 |
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