基因表达系列分析法(SAGE)的改进及其在植物功能基因组研究中的应用 |
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引用本文: | 张振乾,谭太龙,肖钢,官春云.基因表达系列分析法(SAGE)的改进及其在植物功能基因组研究中的应用[J].广西农业生物科学,2009(6):1204-1210. |
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作者姓名: | 张振乾 谭太龙 肖钢 官春云 |
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作者单位: | 湖南农业大学农学院,国家油料改良中心湖南分中心 |
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基金项目: | 国家973计划(2006CB101600)资助 |
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摘 要: | 基因表达系列分析方法(SAGE)是一种新的基因表达分析方法,与基因芯片技术一样具有高通量的特点,可测定特定组织的基因表达水平,在全基因组水平上同时定量检测数万个基因表达模式;可在未知目的基因的前提下,分析来自一个细胞的全部转录本信息;对已知或未知基因表达进行定性和定量分析。目前,虽然在疾病、发育、细胞凋亡、药物筛选等多个领域已有利用SAGE方法进行的研究,但该方法在植物功能基因组研究中的应用相对较少。本文主要综述了该方法在RNA用量、PCR循环次数、SAGE效能和可靠性、标签长度和未知标签分析等方面的改进及其在植物中构建SAGE文库、筛选新基因、基因表达图谱分析等方面的应用,从而为其在植物功能基因组研究中的进一步应用提供理论参考。
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关 键 词: | 基因系列分析方法(SAGE) 功能基因组 基因表达图谱分析 |
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