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牦牛MITF-M基因序列分析及其在皮肤组织中表达水平
引用本文:张建一,梁春年,裴杰,郭宪,沈友明,阎萍.牦牛MITF-M基因序列分析及其在皮肤组织中表达水平[J].华北农学报,2015(3).
作者姓名:张建一  梁春年  裴杰  郭宪  沈友明  阎萍
作者单位:1. 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,甘肃省牦牛繁育重点实验室,甘肃兰州 730050; 甘肃农业大学动物科学技术学院,甘肃兰州 730070
2. 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,甘肃省牦牛繁育重点实验室,甘肃兰州 730050
基金项目:科技支撑计划项目(2012BAD13B05);行业科研项目
摘    要:研究牦牛MITF-M基因编码区序列及其编码蛋白的结构,以及其在皮肤组织中mRNA的表达水平,探讨MITF-M基因与牦牛毛色形成相关性,以期为揭示牦牛毛色形成分子机理奠定基础。采用RT-PCR技术扩增,成功获得了牦牛MITF-M基因编码区序列。采用生物信息学方法,预测分析MITF-M基因及其编码蛋白的基本理化性质、二级结构等;采用半定量PCR检测技术,检测出MITF-M基因mRNA在牦牛各组织器官中表达水平;通过荧光定量PCR技术检测出在牦牛不同颜色皮肤组织中MITF-M基因mRNA表达水平。结果表明,扩增得到的MITF-M基因的编码区是一条长为1 460 bp的DNA序列。将牦牛的MITF-M基因序列命名为YAK MITF-M,并且在NCBI数据库中注册该基因的登录号为KM985448。牦牛MITF-M序列基因含有一个长度为1 242 bp的开放性阅读框,编码413个氨基酸,二级结构主要以α螺旋和无规则卷曲为主,β折叠和延伸链较少。MITF-M基因编码产物氨基酸邻接系统树表明,牦牛MITF-M与黄牛、绵羊等物种的MITF-M氨基酸具有高度相似性。在牦牛各组织器官中,MITF-M基因mRNA仅在皮肤组织中特异性表达,且在不同毛色牦牛皮肤组织中,MITF-M在黑色被毛皮肤组织中mRNA表达量显著高于白色被毛皮肤组织(P0.01)。

关 键 词:牦牛  MITF-M基因  克隆  生物信息学分析  表达水平

Sequence Analysis and Expression Level Detection of MITF-M Gene in Different Color Skin Tissues of Yak
ZHANG Jian-yi,LIANG Chun-nian,PEI Jie,GUO Xian,SHEN You-ming,YAN Ping.Sequence Analysis and Expression Level Detection of MITF-M Gene in Different Color Skin Tissues of Yak[J].Acta Agriculturae Boreali-Sinica,2015(3).
Authors:ZHANG Jian-yi  LIANG Chun-nian  PEI Jie  GUO Xian  SHEN You-ming  YAN Ping
Abstract:
Keywords:Yak  MITF-M gene  Cloning  Bioinformatic analysis  Expression level
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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