基于高通量测序的长江口中华绒螯蟹雌蟹食性分析 |
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引用本文: | 徐静静,冯广朋,张涛,耿智,杨刚,宋超,李春波.基于高通量测序的长江口中华绒螯蟹雌蟹食性分析[J].水产科学,2023(1):1-10. |
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作者姓名: | 徐静静 冯广朋 张涛 耿智 杨刚 宋超 李春波 |
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作者单位: | 1. 中国水产科学研究院东海水产研究所上海长江口渔业资源增殖和生态修复工程技术研究中心;2. 上海海洋大学水产与生命学院 |
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基金项目: | 国家重点研发计划重点专项(2020YFD0900805);;国家自然科学基金面上项目(31972795);;上海市现代农业产业技术体系项目(沪农科产字2017-4号); |
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摘 要: | 为探究长江中华绒螯蟹雌蟹抱卵前后的食性,在长江口东滩水域采集生殖洄游期中华绒螯蟹雌蟹,采用高通量测序技术,解析其抱卵前后的食物种类组成及其食性特征。试验结果显示,37个食物样品的高质量序列为53 288~90 598个。通过聚类分析共得到423个运算分类单元(OTU),筛选有效序列后,经比对获得的食物类别包括藻类、高等植物、鱼类、甲壳类、软体动物、轮虫、原生动物等。雌蟹抱卵前食物组成中占比较高的类别为高等植物、甲壳动物和鱼类;而在抱卵后食物组成中占比较高的种类为高等植物和藻类。抱卵前的Chao1指数和ACE丰富度指数显著大于抱卵后的,抱卵前、后的Shannon和Simpson多样性指数均无显著性差异。研究结果表明,中华绒螯蟹雌蟹摄食宽度较广,属于机会主义摄食者,亲蟹抱卵前后的食性具有一定的差异性。研究结果揭示了生殖洄游期中华绒螯蟹雌蟹的食物种类组成及雌蟹在抱卵前、后的食性变化特征,并为长江口中华绒螯蟹资源增殖和保护提供科学依据。高通量测序分析技术具有生物检测灵敏度较高的特点,可在一定程度上揭示水生动物的食物种类组成信息,但仍需与传统的胃含物形态学分析方法相结合,以便更准确全面地解析其食...
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关 键 词: | 高通量测序 中华绒螯蟹 食性 雌蟹 |
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