花生籽仁高通量转录组文库构建与检测 |
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引用本文: | 殷冬梅,王允,张幸果,李贺敏,崔党群.花生籽仁高通量转录组文库构建与检测[J].分子植物育种,2015(2):431-437. |
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作者姓名: | 殷冬梅 王允 张幸果 李贺敏 崔党群 |
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作者单位: | 河南农业大学 |
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基金项目: | 国家自然科学基金;河南省科技创新杰出青年基金共同资助 |
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摘 要: | 高质量转录组文库的构建为高通量测序和基因克隆等奠定基础。本研究以花生高、低含油量品种为研究对象,成功构建了花生籽仁早期和中后期4个转录组测序文库,利用Solexa高通量测序平台,共获得53 924 092条Clean reads,总测序长度达4 853 168 280 nt,组装后获得59 236条Unigenes序列,总长度为44 505 000 nt,平均长度为751 nt,N50值高达1 130,大于等于2 000 nt的Unigenes有3 643条,占总Unigenes的6.15%。研究结果表明组装质量较高,为花生种子特定发育时期的表达谱分析、为花生高、低含油量品种油脂合成差异基因的筛选奠定了良好的基础。
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关 键 词: | 花生 籽仁 转录组文库 |
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