| 大口黑鲈MsDmrt3的基因结构、系统进化及时空表达 |
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| 引用本文： | 生锡绘,董浚键,孙成飞,李武辉,胡婕,田园园,高风英,闫宁宁,杨超,卢迈新,陈刚,叶星.大口黑鲈MsDmrt3的基因结构、系统进化及时空表达[J].中国水产科学,2021,28(11):1406-1416. |
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| 作者姓名： | 生锡绘 董浚键 孙成飞 李武辉 胡婕 田园园 高风英 闫宁宁 杨超 卢迈新 陈刚 叶星 |
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| 作者单位： | 广东海洋大学水产学院, 广东 湛江 524088 ；中国水产科学研究院珠江水产研究所, 农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室, 广东 广州 510380;中国水产科学研究院珠江水产研究所, 农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室, 广东 广州 510380 ；上海海洋大学水产与生命学院, 上海 201306;广东海洋大学水产学院, 广东 湛江 524088 ；中国水产科学研究院珠江水产研究所, 农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室, 广东 广州 510380 ；上海海洋大学水产与生命学院, 上海 201306 |
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| 基金项目： | 财政部和农业农村部: 国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-46)；广东省重点领域研发计划项目(No.2021B020202000)； 中国水产科学研究院鳜鲈基因组学与选择技术创新团队专项(2020TD23)； 中国水产科学研究院珠江水产研究所鳜鲈基因组学与选择技术创新团队专项(2020ZJTD-02). |
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| 摘 要： | 基于大口黑鲈(Micropterus salmoides)全长转录组数据, 克隆测序获得大口黑鲈 MsDmrt3cDNA 序列, 其开放阅读框为 1245 bp, 共编码 474 个氨基酸, 含有高保守的 DM 结构域和 DMA 结构域, 且 DM 结构域有 2 个保守的锌指样结合位点。蛋白三维预测结构与人(Homo sapiens)和青鳉(Oryzias latipes)的 DMRT3 相似。结合大口黑鲈基因组数据分析显示, MsDmrt3 位于基因组 7 号染色体上, 基因序列 3353 bp, 由 2 个外显子与 1 个内含子组成。进化树聚类分析显示, MsDMRT3 属于 DMRT3 家族, 且可能与低等节肢动物 Dmrt93B 起源于共同的原始 DMRT。对大口黑鲈 14 种组织以及 8 个发育时期的 MsDmrt3 基因的表达情况进行定量分析, 结果显示 MsDmrt3 基因在成熟个体的脊髓中高表达, 精巢和眼次之, 但在卵巢和肝脏几乎不表达; MsDmrt3 在各发育时期均有表达, 在 6 dpf 前呈逐渐上调趋势, 之后逐渐下调至最低水平。本研究表明, MsDmrt3 基因序列与结构具有高保守性, 且具有显著的性别表达二态性, 推测其与性别决定和分化有关。同时, 根据 MsDmrt3 基因在脊椎和胚胎发育早期的高表达, 推测其可能在神经系统和胚胎早期生长发育中发挥作用。本研究旨在为下一步大口黑鲈性别决定与性别分化分子机制的深入研究奠定基础。
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| 关 键 词： | 大口黑鲈 MsDmrt3 基因 基因结构 系统进化分析 时空表达 |
Genomic organization and phylogenetic and temporal-spatial expres sion analysis of Msdmrt3 in largemouth bass (Micropterus salmoides) |
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| Sheng Xihui,Dong Junjian,Sun Chengfei,Li Wuhui,Hu Jie,Tian Yuanyuan,Gao Fengying,Yan Ningning,Yang Chao,Lu Maixin,Chen Gang,Ye Xing.Genomic organization and phylogenetic and temporal-spatial expres sion analysis of Msdmrt3 in largemouth bass (Micropterus salmoides)[J].Journal of Fishery Sciences of China,2021,28(11):1406-1416. |
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| Authors: | Sheng Xihui Dong Junjian Sun Chengfei Li Wuhui Hu Jie Tian Yuanyuan Gao Fengying Yan Ningning Yang Chao Lu Maixin Chen Gang Ye Xing |
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