| 三角帆蚌溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶1HcLPCAT1基因功能分析及壳色性状相关SNP筛选 |
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| 引用本文： | 张进盼,白志毅,张梦莹,颜玲,陆风辉,王贺.三角帆蚌溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶1HcLPCAT1基因功能分析及壳色性状相关SNP筛选[J].中国水产科学,2021,28(11):1373-1384. |
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| 作者姓名： | 张进盼 白志毅 张梦莹 颜玲 陆风辉 王贺 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学, 农业农村部淡水水产种质资源重点实验室, 上海 201306 ；上海海洋大学, 水产动物遗传育种中心上海市协同创新中心, 上海 201306;上海海洋大学, 农业农村部淡水水产种质资源重点实验室, 上海 201306 ；上海海洋大学, 上海市水产养殖工程技术研究中心, 上海 201306 ；上海海洋大学, 水产动物遗传育种中心上海市协同创新中心, 上海 201306 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31872565)； 财政部和农业农村部: 国家现代农业产业技术体系资助项目； 上海市优秀学术带头人计划资助项目(19XD1421500). |
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| 摘 要： | 溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶 1(LPCAT1)是一种重要的脂质代谢酶。为明确三角帆蚌(Hyriopsis cumingii) HcLPCAT1 基因在类胡萝卜素代谢中的功能, 探究该基因与三角帆蚌壳色的相关性, 本研究采用 RACE 技术克隆获得 HcLPCAT1 基因 cDNA 全长 1675 bp, ORF 区 1296 bp 编码 431 个氨基酸; 实时荧光定量分析发现 HcLPCAT1 基因在紫色三角帆蚌各组织中表达量均高于白色三角帆蚌相应组织, 且在肝胰腺、外套膜中的表达量差异显著 (P＜0.05); 原位杂交检测到的阳性信号主要定位在外套膜的外褶、背膜区、腹膜区, 外褶与中褶连接处以及部分中褶; 紫色三角帆蚌补充投喂 β-胡萝卜素后, HcLPCAT1 基因在肝胰腺、中央膜、边缘膜各组织中表达量极显著上调 (P＜0.01), 同时相应组织中总类胡萝卜素含量(TCC)极显著升高(P＜0.01)。采用直接测序法鉴定出三角帆蚌 HcLPCAT1 基因 5 个 SNP 位点的基因型与内壳色存在显著相关性(P＜0.05), 单倍型分析发现 H1、H2 两种单倍型为紫色三角帆蚌优势单倍型, H3、H5、H6 三种单倍型为白色三角帆蚌优势单倍型。本研究鉴定的 HcLPCAT1 基因可为解析三角帆蚌类胡萝卜素代谢和壳色形成的机制提供研究基础, 筛选的与内壳色相关 SNP 及单倍型可用于分子辅助育种。
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| 关 键 词： | 三角帆蚌 LPCAT1 基因 类胡萝卜素 SNP 标记 内壳色 |
Functional analysis and SNP screening of lysophosphaticly lcholine acyltransferase 1 HcLPCAT1 gene and its association analysis with shell color traits in Hyriopsis cumingii |
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| ZHANG Jinpan,BAI Zhiyi,ZHANG Mengying,YAN Ling,LU Fenghui,WANG He.Functional analysis and SNP screening of lysophosphaticly lcholine acyltransferase 1 HcLPCAT1 gene and its association analysis with shell color traits in Hyriopsis cumingii[J].Journal of Fishery Sciences of China,2021,28(11):1373-1384. |
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| Authors: | ZHANG Jinpan BAI Zhiyi ZHANG Mengying YAN Ling LU Fenghui WANG He |
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