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李属坏死环斑病毒新疆分离物运动蛋白基因片段的克隆与序列分析
引用本文:韩剑,罗明,殷智婷,周国辉,张祥林.李属坏死环斑病毒新疆分离物运动蛋白基因片段的克隆与序列分析[J].植物保护学报,2015,42(4):564-570.
作者姓名:韩剑  罗明  殷智婷  周国辉  张祥林
作者单位:新疆农业大学农学院, 乌鲁木齐 830052;新疆农业大学农学院, 乌鲁木齐 830052;新疆农业大学农学院, 乌鲁木齐 830052;华南农业大学资源与环境学院, 广州 510642;新疆出入境检验检疫局, 乌鲁木齐 830052
基金项目:新疆维吾尔自治区自然科学基金(2012211B25)
摘    要:为进一步揭示李属坏死环斑病毒(Prunus necrotic ringspot virus,PNRSV)新疆巴旦木分离物的分子特征、遗传变异及其与宿主之间的相互关系,采用RT-PCR方法扩增并克隆了4个PNRSV新疆巴旦木分离物运动蛋白(move protein,MP)基因片段,并进行了测序及序列同源性分析。结果表明,4个新疆巴旦木PNRSV分离物MP基因片段分别为259、258、254、260 bp;其核苷酸和氨基酸序列与已报道的PNRSV分离物的同源性分别为72.7%~91.7%和75.6%~92.9%,表现出明显差异,其中与美国分离物CH9同源性最高,分别达88.8%~91.7%和82.6%~92.9%;而与同属03亚组的苹果花叶病毒(Apple mosaic virus,Ap MV)同源性较低,仅为51.2%~58.1%和52.3%~61.9%;新疆PNRSV各分离株之间MP基因核苷酸序列同源性较高。系统发育树显示,4个新疆巴旦木PNRSV分离物与Ⅰ组代表毒株PV32的核苷酸序列同源性达88.4%~91.3%,并与Ⅰ组分离物聚集成簇,表明PNRSV新疆巴旦木分离物属于引起严重症状的Ⅰ组株系,且Ⅰ组中各分离物之间表现出一定的寄主相关性,而Ⅱ组和Ⅲ组中各分离物之间未表现出明显的寄主相关性。

关 键 词:李属坏死环斑病毒  巴旦木  RT-PCR  MP基因
收稿时间:2014/7/30 0:00:00

Cloning and sequence analysis of MP gene of Prunus necrotic ringspot virus from almond plants in Xinjiang
Han Jian,Luo Ming,Yin Zhiting,Zhou Guohui and Zhang Xianglin.Cloning and sequence analysis of MP gene of Prunus necrotic ringspot virus from almond plants in Xinjiang[J].Acta Phytophylacica Sinica,2015,42(4):564-570.
Authors:Han Jian  Luo Ming  Yin Zhiting  Zhou Guohui and Zhang Xianglin
Institution:College of Agriculture, Xinjiang Agricultural University, Urumqi 830052, Xinjiang Uygur Autonomous Region, China;College of Agriculture, Xinjiang Agricultural University, Urumqi 830052, Xinjiang Uygur Autonomous Region, China;College of Agriculture, Xinjiang Agricultural University, Urumqi 830052, Xinjiang Uygur Autonomous Region, China;College of Natural Resources and Environment, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, Guangdong Province, China;Xinjiang Entry and Exit Inspection and Quarantine Portal, Urumqi 830052, Xinjiang Uygur Autonomous Region, China
Abstract:
Keywords:Prunus necrotic ringspot virus (PNRSV)  almond  RT-PCR  MP gene
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