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检疫性杂草毒莴苣EST-SSR标记的开发及应用
引用本文:梁照文,童明龙,高振峰,张宝俊,伏建国,范晓虹.检疫性杂草毒莴苣EST-SSR标记的开发及应用[J].植物保护学报,2015,42(4):578-583.
作者姓名:梁照文  童明龙  高振峰  张宝俊  伏建国  范晓虹
作者单位:宜兴出入境检验检疫局, 江苏 宜兴 214206;宜兴出入境检验检疫局, 江苏 宜兴 214206;山西农业大学农学院, 太谷 030801;山西农业大学农学院, 太谷 030801;江苏出入境检验检疫局, 南京 210095;中国检验检疫科学研究院, 北京 100123
基金项目:江苏检验检疫局科技计划(2012KJ56),山西农业大学育种基金(2014YZ2-7),山西省青年科技研究基金(2012021025-2)
摘    要:为明确毒莴苣EST序列中SSR的特点,并开发EST-SSR分子标记用于毒莴苣及其近似种的分类鉴定及遗传多样性分析,以筛选的7 438条毒莴苣EST序列为基础,利用SSRIT软件结合人工搜索查找SSR位点,并采用Primer Premier 5.0软件设计EST-SSR引物,以毒莴苣及其近似种为材料对所合成引物进行多态性检测,应用UPGMA法构建11个毒莴苣及其近似种的系统发育树。结果表明,共搜索到SSR位点1 465个,发现重复基元598种,其中二、三、六核苷酸重复是主要的重复类型。合成的24对引物中有9对表现出多态性,利用这9对EST-SSR引物分析毒莴苣等11份材料的亲缘关系,其相似性系数在0.432~1.000之间;于0.513处可被划分为3大类:Ⅰ类包括翅果菊和北山莴苣,Ⅱ类只有宿根莴苣1种,Ⅲ类包括毒莴苣和莴苣。

关 键 词:毒莴苣  近似种  EST-SSR  遗传多样性
收稿时间:2014/11/15 0:00:00

Development and utility of EST-SSR marker in quarantine weed Lactuca serriola
Liang Zhaowen,Tong Minglong,Gao Zhenfeng,Zhang Baojun,Fu Jianguo and Fan Xiaohong.Development and utility of EST-SSR marker in quarantine weed Lactuca serriola[J].Acta Phytophylacica Sinica,2015,42(4):578-583.
Authors:Liang Zhaowen  Tong Minglong  Gao Zhenfeng  Zhang Baojun  Fu Jianguo and Fan Xiaohong
Institution:Yixing Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau, Yixing 214206, Jiangsu Province, China;Yixing Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau, Yixing 214206, Jiangsu Province, China;College of Agriculture, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, Shanxi Province, China;College of Agriculture, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, Shanxi Province, China;Jiangsu Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau, Nanjing 210095, Jiangsu Province, China;Chinese Academy of Inspection and Quarantine, Beijing 100123, China
Abstract:
Keywords:Lactuca serriola  closely related species  EST-SSR  genetic diversity
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