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赤霉素诱导甘蔗节间伸长基因的cDNA-SCoT差异表达分析
引用本文:吴建明,李杨瑞,王爱勤,杨柳,杨丽涛.赤霉素诱导甘蔗节间伸长基因的cDNA-SCoT差异表达分析[J].作物学报,2010,36(11):1883-1890.
作者姓名:吴建明  李杨瑞  王爱勤  杨柳  杨丽涛
作者单位:1 广西农业科学院经济作物研究所,广西南宁 530004;2 广西作物遗传改良生物技术重点开发实验室,广西南宁 530007;3广西大学广西亚热带生物资源保护利用重点实验室,广西南宁 530007;4中国农业科学院甘蔗研究中心,广西南宁 530007
基金项目:国家科技支撑计划项目,广西科技攻关重点项目,广西科技攻关项目,现代农业产业技术体系建设专项资
摘    要:以甘蔗ROC22为材料,在伸长初期进行叶面喷施200 mg L–1浓度的赤霉素为处理,以喷施清水为对照,在不同时间取幼茎样品,用cDNA-SCoT进行基因差异表达分析。结果表明,通过46条引物筛选了约700个cDNA片段,获得差异片段30个。有18个基因片段受赤霉素上调而12个基因片段下调;其中16个TDFs序列和NCBI数据库中已录入的基因具有较高的相似性,按照其功能可分为6类,即能量与代谢相关基因(占总数的20.0%)、未知功能蛋白(占总数的20.0%)、未知基因(占总数的46.7%)、信号传导相关基因(占总数的6.7%)和转录因子相关基因(占总数的3.3%);细胞凋亡基因(3.3%)。这说明利用SCoT方法可以进行蔗茎基因差异表达研究,分离到的一些差异片段可能是与甘蔗节间伸长相关的基因。

关 键 词:甘蔗  cDNA-SCoT  差异表达  赤霉素
收稿时间:2010-01-04

Differential Expression of Gibberellin-Induced Genes for Stalk Elongation of Sugarcane Analyzed with cDNA-ScoT
WU Jian-Ming,LI Yang-Rui,WANG Ai-Qin,YANG Liu,YANG Li-Tao.Differential Expression of Gibberellin-Induced Genes for Stalk Elongation of Sugarcane Analyzed with cDNA-ScoT[J].Acta Agronomica Sinica,2010,36(11):1883-1890.
Authors:WU Jian-Ming  LI Yang-Rui  WANG Ai-Qin  YANG Liu  YANG Li-Tao
Institution:1.Cash Crops Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences, Nanning 530007, China;2.Guangxi Crop Genetic Improvement and Biotechnology Lab, Nanning 530007, China;3.Guangxi Key Laboratory of Subtropical Bioresources Conservation and Utilization, Guangxi University, Nanning 530004, China;4.Sugarcane Research Center, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Nanning 530007, China
Abstract:
Keywords:Gibberellin  Sugarcane  cDNA-SCoT  Differential expression
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