| 芸苔链格孢菌与白菜互作基因表达谱芯片分析 |
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| 引用本文： | 刘影,徐文静,杜茜,杨信东,李启云.芸苔链格孢菌与白菜互作基因表达谱芯片分析[J].北方园艺,2010(7):116-118. |
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| 作者姓名： | 刘影 徐文静 杜茜 杨信东 李启云 |
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| 作者单位： | 吉林省农业科学院,吉林,长春,130124;吉林农业大学,农学院,吉林,长春,130118;吉林省农业科学院,吉林,长春,130124;吉林农业大学,农学院,吉林,长春,130118 |
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| 基金项目： | 吉林省农业科学院博士启动基金 |
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| 摘 要： | 利用拟南芥基因芯片,对白菜经芸薹链格孢菌侵染前后的基因表达谱进行比较分析。结果表明:差异表达基因385个,其中上调基因为280个,下调基因为105个。将所筛选出的差异表达基因分为14类,即:病程相关基因,防御相关基因,氧爆作用类,信号转导类,激素相关类,运输类,非生物胁迫类,细胞维持与发育,细胞壁修饰类,次生代谢类,代谢与合成类,蛋白降解类,及假想蛋白和未知功能蛋白。生物信息学分析显示,检测到的信号转导类基因差异表达比例最高,占24%;其次,防御基因和代谢合成基因占的比例也较高,分别达到13%和14%。值得注意的是,直接与病程发生相关差异表达的基因很少。同时,在差异表达基因中,未知蛋白和假想蛋白占有很大比例。
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| 关 键 词： | 白菜黑斑病 基因芯片 差异表达 |
Analysis of Gene Expression Profiles in Response to Alternaria brassicae in Brassica rapa |
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