| 四球茶转录组SSR位点信息分析 |
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| 引用本文： | 黎瑞源,邢辉,申铁.四球茶转录组SSR位点信息分析[J].安徽农业大学学报,2017,44(4):558-562. |
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| 作者姓名： | 黎瑞源 邢辉 申铁 |
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| 作者单位： | 贵州师范大学贵州省信息与计算科学重点实验室,贵阳,550001;贵州师范大学贵州省信息与计算科学重点实验室,贵阳,550001;贵州师范大学贵州省信息与计算科学重点实验室,贵阳,550001 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金地区项目（31460233）和贵州师范大学博士基金（11904/0514027）共同资助。 |
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| 摘 要： | 对基于高通量测序拼接获得的99 741条四球茶嫩叶Unigenes进行了SSR(simple sequence repeats)位点分析,共揭示了23 732个SSR位点,分布于18 552条Unigenes中,SSR发生频率为23.79%;含有SSR位点的Unigenes的总长度为226 188 bp,SSR位点间的平均距离为1/2.07 kb,重复长度平均长度为9.53 bp。在四球茶转录组SSR中,二核苷酸重复和三核苷酸重复是主要的重复类型,分别占总SSRs的47.53%和25.92%;在181种重复基元类型中,优势重复基元分别是AG/CT、A/T、ACC/GGT,分别占总SSRs的41.38%、22.10%和6.49%,共占总SSRs的比例达69.97%。
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| 关 键 词： | 四球茶 转录组 SSR |
| 收稿时间： | 2016/10/22 0:00:00 |
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