猪胸膜肺炎放线杆菌ApxⅠA基因克隆与生物信息学分析 |
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引用本文: | 阮业召,姜家麟,罗维,郭小权,胡国良,刘平.猪胸膜肺炎放线杆菌ApxⅠA基因克隆与生物信息学分析[J].湖南农业大学学报(自然科学版),2018,44(5). |
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作者姓名: | 阮业召 姜家麟 罗维 郭小权 胡国良 刘平 |
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作者单位: | 江西农业大学动物群发性疾病监测与防治研究所;湖南斯莱克景达实验动物有限公司 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31402266);江西省科技支撑计划项目(20141BBF60035);江西省自然(青年)科学基金项目重点项目(20171ACB21026);江西省教育厅科学技术研究重点项目(GJJ170243);江西省研究生创新专项资金项目(YC2017–S185) |
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摘 要: | 通过提取猪传染性胸膜肺炎放线杆菌ApxⅠA基因组DNA,运用PCR方法扩增ApxⅠA基因片段,并采用TA克隆技术获得pMD18–T–ApxⅠA重组质粒,进行生物信息学分析。结果表明:成功获得长度为1 209 bp的ApxⅠA基因;ApxⅠA蛋白的理化性质稳定;ApxⅠA蛋白有磷酸化位点,但无糖基化位点;信号肽预测ApxⅠA蛋白无信号肽;ApxⅠA蛋白为亲水性蛋白,无跨膜结构;预测二级结构主要由无规则卷曲构成,占50.62%,α–螺旋占25.56%,β–折叠占23.82%,三级结构主要由无规则卷曲和β–折叠构成。
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关 键 词: | 猪传染性胸膜肺炎 放线杆菌 ApxⅠA基因 分子克隆 生物信息学分析 |
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