| 换锦花EST-SSR标记开发及遗传多样性分析 |
| |
| 引用本文： | 石艳,童再康,高燕会.换锦花EST-SSR标记开发及遗传多样性分析[J].核农学报,2018(6). |
| |
| 作者姓名： | 石艳 童再康 高燕会 |
| |
| 作者单位： | 浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室 |
| |
| 摘 要： | 为开发换锦花EST-SSR标记和分析其遗传多样性,本研究利用MISA软件对换锦花转录组信息进行SSR位点检测,再利用Primer3.0设计引物,经PCR扩增和非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测引物的有效性和多态性,并绘制换锦花种质资源的聚类图。结果表明,共检测到9 918个SSR位点,发生频率为18.59%,分布距离为3.729 kb;SSR位点重复单元为1~3个碱基,其中,单碱基重复三碱基重复二碱基重复,分别占SSR总数的61.08%、23.22%和14.23%,四碱基及以上重复单元相对较少。共设计出9 302对SSR引物,随机选取并合成278对引物进行PCR扩增,能够清晰扩增出的引物有185对(66.55%),在石蒜属的七个种中具有多态性的有59对(31.89%),其中11对(18.64%)能够在浙江和江苏种群的30份换锦花种质资源表现出丰富的多态性。综上,本研究开发的EST-SSR标记具有丰富的多态性,在换锦花以及石蒜属植物的遗传多样性分析、杂交种鉴定及遗传图谱的构建应用中具有重要意义。
|
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
|
