| 干旱处理下2个梨品种转录组差异表达基因分析 |
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| 引用本文： | 王华,汪王微,刘春旖,王巧巧,朱立武,徐小牛.干旱处理下2个梨品种转录组差异表达基因分析[J].华南农业大学学报,2018,39(4):61-67. |
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| 作者姓名： | 王华 汪王微 刘春旖 王巧巧 朱立武 徐小牛 |
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| 作者单位： | 安徽农业大学果树学重点实验室;安徽农业大学林学与园林学院 |
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| 基金项目： | 国家现代农业产业技术体系建设专项（CARS-29-14）；安徽省高校自然科学研究项目（KJ2016A237，KJ2016A558） |
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| 摘 要： | 【目的】以转录组数据为基础挖掘梨抗旱关键基因,为培育梨抗旱品种提供理论基础。【方法】以正常浇水和干旱处理下黄冠梨Pyrus bretschneideri‘Xuehuali’×P.pyrifolia‘Shinsseiki’和黄金梨P.pyrifolia‘Niitaka’×P.pyrifolia‘Nijisseiki’的叶片进行Illumina Hi Seq TM 2000高通量转录组测序分析,利用基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库分析2个梨品种中的差异表达基因(DEGs)。【结果】2个梨品种间在正常浇水和干旱处理下分别发现了4 377和3 841个DEGs,其中只在干旱处理下的DEGs有1 340个。这些DEGs在GO数据库的3个本体生物过程、分子功能和细胞成分中富集到的数量分别是1 387、922和1 253个,与植物抗旱相关的代谢过程、应激反应和生物膜等条目分别富集到349、139和151个DEGs。仅在干旱处理下的1 340个DEGs被比对到102个KEGG代谢通路上,其中与植物内源激素相关的代谢通路有3个。将1 340个DEGs进行转录因子分析发现,被注释为转录因子的有37个,分布在17个转录因子家族中,其中乙烯应答转录因子(ERF)家族所拥有的DEGs最多,为11个。【结论】本研究发现了与梨抗旱相关的内源激素代谢基因和转录因子,干旱胁迫下这些基因在2个梨品种中差异表达,这可能与2个品种的抗旱性差异存在密切关系,为下一步梨抗旱分子机理研究奠定了基础。
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| 关 键 词： | 梨 干旱 转录组 差异表达基因 代谢通路 转录因子 |
| 收稿时间： | 2017/12/25 0:00:00 |
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