| 长穗偃麦草LBD基因家族的鉴定与进化分析 |
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| 引用本文： | 王新华,许娜丽,姚明明,余慧霞,王彦青,邱国岩,刘凤楼,刘彩霞,张晓岗,李清峰,王掌军.长穗偃麦草LBD基因家族的鉴定与进化分析[J].西北农业学报,2022(2):202-216. |
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| 作者姓名： | 王新华 许娜丽 姚明明 余慧霞 王彦青 邱国岩 刘凤楼 刘彩霞 张晓岗 李清峰 王掌军 |
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| 作者单位： | （1.宁夏大学 农学院，银川 750021；2.宁夏优势特色作物分子育种重点实验室，银川 750021） |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（31801349）；第四批“宁夏青年科技人才托举工程”（TJGC2019062）；宁夏自治区农业育种专项（2018NYYZ02）； 宁夏自治区科技重大专项（2019BBF02022-01）。 |
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| 摘 要： | 为深入研究长穗偃麦草LBD基因家族中基因的结构与功能以及小麦与其近缘属的进化关系，以长穗偃麦草LBD（Lateral organ boundaries domain）基因家族为研究对象，生物信息学分析发现该基因家族含有32个成员，根据其结构域特征，可分为Class Ⅰ和Class Ⅱ两个亚家族，Class Ⅰ又可分为ⅠA、ⅠB、ⅠC、ⅠD和ⅠE，Class Ⅱ可分为ⅡA和ⅡB；该基因家族的结构域、基因结构相对保守，不同成员之间具有相似的蛋白二级和三级结构。对32个基因的上游序列预测，发现基因上游序列中含有光响应、多种激素、逆境响应等顺式作用元件，说明LBD基因的表达受到光、激素、逆境等多种因素的诱导。与普通小麦、圆锥小麦、乌拉尔图小麦、粗山羊草、大麦进行共线性分析发现，Tel-2E-LBD2、Tel-3E-LBD4、Tel-4E-LBD1和Tel-4E-LBD6为长穗偃麦草特有的LBD基因，而其他28个LBD基因在进化中具有高度的保守性；在普通小麦、圆锥小麦、乌拉尔图小麦和大麦基因组中均发现第1、3部分同源群染色体上存在染色体间的片段重复；普通小麦、圆锥小麦和乌拉尔图小麦的A基因组中第4、5部分同源群染色体均有易位现象，同时，乌拉尔图小麦4A染色体上存在染色体内片段重复而在普通小麦和圆锥小麦的A基因组上发现第4部分同源群染色体内易位与倒位。
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| 关 键 词： | 长穗偃麦草 LBD基因家族 小麦近缘属 进化 |
Identification and Evolution Analysis of LBD Gene Family in Thinopyrum elongatum |
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| WANG Xinhu,XU Nali,YAO Mingming,YU Huixi,WANG Yanqing,QIU Guoyan,LIU Fenglou,LIU Caixi,ZHANG Xiaogang,LI Qingfeng and WANG Zhangjun.Identification and Evolution Analysis of LBD Gene Family in Thinopyrum elongatum[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2022(2):202-216. |
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| Authors: | WANG Xinhu XU Nali YAO Mingming YU Huixi WANG Yanqing QIU Guoyan LIU Fenglou LIU Caixi ZHANG Xiaogang LI Qingfeng and WANG Zhangjun |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Thinopyrum elongatum LBD gene family Wheat relatives Evolution |
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