| 沼泽红假单胞菌LuxR家族调控蛋白的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 杨艳北,许晶,李袁飞,贡继尚,饶友生.沼泽红假单胞菌LuxR家族调控蛋白的生物信息学分析[J].江苏农业科学,2021,49(6):40-45. |
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| 作者姓名： | 杨艳北 许晶 李袁飞 贡继尚 饶友生 |
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| 作者单位： | 南昌师范学院生物技术研究所/江西省地方鸡种遗传改良重点实验室,江西南昌330000;南昌师范学院生物系,江西南昌330000 |
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| 基金项目： | 江西省教育厅科学技术研究项目;南昌师范学院博士科研启动基金;南昌师范学院"11531"工程;南昌师范学院校级科研项目;国家自然科学基金 |
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| 摘 要： | LuxR家族调控蛋白调控革兰氏阴性细菌群体感应系统,从而影响细菌生物被膜的形成.利用在线生物信息学预测软件,分析LuxR家族调控蛋白序列,对其理化性质、亲水性/疏水性、亚细胞定位、信号肽、二级结构、三级结构、磷酸化位点、跨膜结构域和功能结构域进行分析和预测,为后续研究生物被膜形成机制奠定基础,也为生物被膜增强剂的开发提供新的思路.结果表明:LuxR家族调控蛋白为不稳定的亲水性蛋白;定位在细菌的细胞质中;无信号肽结构,推断其为非分泌性蛋白;二级结构中含有α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲等结构元件;α-螺旋和无规则卷曲对三级结构的稳定和功能发挥具有重要意义;含有5个磷酸化位点,其中丝氨酸磷酸化位点包括第79位、第165位和第171位氨基酸,其中苏氨酸磷酸化位点包括第90位和第211位氨基酸;无跨膜结构域,推测LuxR家族调控蛋白不属于跨膜蛋白;LuxR家族调控蛋白参与细菌群体感应系统,含有2个保守结构域,分别为Autoind_bind和HTH_LUXR,该蛋白通过这2个保守结构域起到转录调控的作用.
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| 关 键 词： | 沼泽红假单胞菌 LuxR 生物信息学 生物被膜 |
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