| 松乳菇子实体两个发育时期的转录组分析 |
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| 引用本文： | 宋志强,丁祥,唐贤,朱淼,侯怡铃.松乳菇子实体两个发育时期的转录组分析[J].浙江农业学报,2020,32(2):337. |
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| 作者姓名： | 宋志强 丁祥 唐贤 朱淼 侯怡铃 |
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| 作者单位： | 1.西华师范大学 生命科学学院,西南野生动植物资源保护教育部重点实验室,四川 南充 637009; 2.西华师范大学 环境科学与工程学院,四川 南充 637009 |
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| 基金项目： | 四川省科技厅应用基础重点项目(2018JY0087); 四川省科技厅重点研发项目(2018NZ0055); 南充市科技局项目(16YFZJ0043) |
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| 摘 要： | 以松乳菇子实体为研究材料,采用de novo测序对松乳菇子实体进行测序与生物信息学分析,探究松乳菇子实体生长发育过程中幼菇期(LDG-1)和成熟期(LDG-2)基因表达的差异,并探寻影响松乳菇生长发育相关的主要基因和代谢通路。测序结果显示,共获得7.44G(LDG-1)和7.21G(LDG-2)的分析数据(clean reads)。KOG功能注释结果显示,松乳菇在幼菇期(LDG-1)和成熟期(LDG-2)具有全面而复杂的基因功能类别。GO富集结果提示,松乳菇在不同生长阶段(LDG-1和LDG-2)的生物代谢功能存在一定的差异。基因表达水平与聚类分析显示,ATP酶、多功能伴侣蛋白等家族基因为LDG-1和LDG-2主要高表达基因,在能量代谢与参与调控细胞周期中起重要作用。分析差异表达基因发现,相较于LDG-1期,LDG-2期有16 789个差异表达基因,其中7 635个基因上调,9 154个基因下调。差异表达基因KEGG富集通路分析结果显示,氧化磷酸化途径是松乳菇幼菇期生长发育过程中能量代谢的关键途径。进一步分析显示,MAPK信号通路是影响松乳菇子实体发育的关键信号通路,在促进松乳菇子实体进行有性生殖和调控菌丝体的极性生长中起重要作用。
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| 关 键 词： | 松乳菇 de novo测序 差异表达基因 氧化磷酸化 MAPK信号通路 |
| 收稿时间： | 2019-05-10 |
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