| 烟草品种Xanthi NN碱性β-1,3-葡聚糖酶基因的克隆与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 王转梅,陈崇顺,王轶,曹伟杰,邹爱兰,马文晔,张娟.烟草品种Xanthi NN碱性β-1,3-葡聚糖酶基因的克隆与生物信息学分析[J].江苏农业科学,2009(1). |
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| 作者姓名： | 王转梅 陈崇顺 王轶 曹伟杰 邹爱兰 马文晔 张娟 |
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| 作者单位： | 南京师范大学生命科学学院/江苏省生物多样性与生物技术重点实验室,江苏,南京,210046 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(编号:30371010) |
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| 摘 要： | 烟草碱性β－1，3－葡聚糖酶具有较强的抗真菌病害等作用。本研究根据烟草Samsun与抗真菌作用有关的碱性8—1，3－葡聚糖酶基因序列设计引物，以烟草（Nicotiana tabacum）品种Xanthi NN基因组DNA为模板，进行PCR扩增，后将扩增产物与pUC57－T载体重组，再以该重组体转化大肠杆菌DHSα，在对阳性克隆进行鉴定后测序，并对其编码酶蛋白进行了一级、二级、三级结构及蛋白质同源性比较等生物信息学分析。研究结果表明，该基因全长1868bp，包含2个外显子和1个内含子；除终止密码子外，共编码359个氨基酸（GenBank登录号：EU867448）。该酶分子量为28．4kDa，pI为9．72，是一个碱性蛋白；具有多个螺旋、转角、延伸链和无规卷曲等二级结构，其中α－螺旋占35．65％，β－转角占5．57％，延伸链占19．22％，无规卷曲占39．55％；三级结构同源建模预测显示，它与香蕉（Musa supientum）β－1，3－葡聚糖酶（PDB number 2cygA）具有60％的一致性；推测该酶蛋白与颠茄（Atropa belladonna）、马铃薯（Solanum tuberosum）等茄科植物的β－1，3－葡聚糖酶编码序列同源性分别达到89％和81％。本研究结果为进一步开展烟草抗真菌的β—1，3－葡聚糖酶的基因工程研究奠定了重要基础。
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| 关 键 词： | 烟草 基因组 碱性β—1 3－葡聚糖酶基因 克隆 生物信息学 |
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