| 云南蔓草虫豆丛枝植原体rp基因序列分析及结构预测 |
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| 引用本文： | 王柱华,杨子祥,苏帆,何孟兰,毛清源,万琼莲,王连春,蔡红.云南蔓草虫豆丛枝植原体rp基因序列分析及结构预测[J].分子植物育种,2021,19(22):7440-7447. |
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| 作者姓名： | 王柱华 杨子祥 苏帆 何孟兰 毛清源 万琼莲 王连春 蔡红 |
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| 作者单位： | 云南农业大学,农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室,昆明,650201;云南省农业科学院热区生态农业研究所,元谋,651300;玉溪师范学院化学生物与环境学院,玉溪,653100 |
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| 摘 要： | 为了从亚组水平上明确云南元谋县的蔓草虫豆丛枝植原体的分类地位,本研究以rp(Ⅱ)F1/rp(Ⅱ)R1为引物,利用PCR对感病蔓草虫豆总DNA进行rp基因扩增.扩增产物进行序列分析和编码蛋白特性预测,并通过生物信息学软件对rp基因编码的rp122、rps3蛋白特性进行分析.结果 表明,PCR扩增测序得到1171 bp的特异性片段,该片段包括全部rpl22基因和大部分rps3基因,两基因相互重叠,分别编码128和237个氨基酸.通过同源性比对及系统进化树分析,从亚组水平明确了蔓草虫豆丛枝植原体是16SrⅡ-A亚组成员,且归属于rp-iii亚进化支.预测rp基因所编码的rp122和rps3蛋白均为脂溶性蛋白,且二级结构包括螺旋、卷曲和折叠.本研究结果可为深入研究蔓草虫豆丛枝植原体蛋白跨膜运输的分子机理提供一定的理论参考.
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| 关 键 词： | 蔓草虫豆丛枝植原体 rp基因 序列分析 结构预测 |
Sequence Analysis and Structure Prediction of rp Gene of Cajanus scara-baeoides Witches' -broom Phytoplasma in Yunnan Province |
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| Wang Zhuhua,Yang Zixiang,Su Fan,He Menglan,Mao Qingyuan,Wan Qionglian,Wang Lianchun,Cai Hong.Sequence Analysis and Structure Prediction of rp Gene of Cajanus scara-baeoides Witches' -broom Phytoplasma in Yunnan Province[J].Molecular Plant Breeding,2021,19(22):7440-7447. |
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| Authors: | Wang Zhuhua Yang Zixiang Su Fan He Menglan Mao Qingyuan Wan Qionglian Wang Lianchun Cai Hong |
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