| 基于BSA-seq技术挖掘芝麻株高相关候选基因 |
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| 引用本文： | 崔彦芹,郭元章,侯少锋,李思达,关中波,徐桂真.基于BSA-seq技术挖掘芝麻株高相关候选基因[J].华北农学报,2021,36(z1):8-15. |
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| 作者姓名： | 崔彦芹 郭元章 侯少锋 李思达 关中波 徐桂真 |
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| 作者单位： | 河北省农林科学院 粮油作物研究所,河北省作物遗传育种实验室,河北 石家庄 050035 |
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| 基金项目： | 国家特色油料产业技术体系项目;河北省省级科技计划;河北省农林科学院创新工程 |
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| 摘 要： | 为了进一步挖掘芝麻株高相关基因,为适机收芝麻新品种选育提供理论指导,以冀航芝1号和DW607为亲本构建F2群体,并构建以株高为目标性状的极端混池,利用BSA-seq技术,采用ED和Δ(SNP-index或InDel-index)2种方法挖掘株高相关的染色体区段,注释区段内的基因信息,利用GO和KEGG等数据库分析注释基因的功能.结果发现,亲本之间共获得298634个SNP和76360个InDel,混池之间共获得24048个SNP和9630个InDel;基于SNP标记的ED方法关联到5个染色体区段,ΔSNP-index方法关联到3个染色体区段,两者的交集有3个;基于InDel标记的ED方法关联到5个染色体区段,ΔInDel-index方法关联到8个染色体区段,两者的交集有8个;4个染色体区段同时被SNP和InDel标记关联到,共注释到330个基因,比对到的前20个KEGG通路主要包括植物激素信号转导和能量代谢;GO富集结果表明,有18个基因参与生长素响应,可能是参与株高调控的关键基因.
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| 关 键 词： | 芝麻 株高 混池测序 候选基因 |
Candidate Gene Detection for Sesame Plant Height Based on BSA-seq |
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| CUI Yanqin,GUO Yuanzhang,HOU Shaofeng,LI Sida,GUAN Zhongbo,XU Guizhen.Candidate Gene Detection for Sesame Plant Height Based on BSA-seq[J].Acta Agriculturae Boreali-Sinica,2021,36(z1):8-15. |
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| Authors: | CUI Yanqin GUO Yuanzhang HOU Shaofeng LI Sida GUAN Zhongbo XU Guizhen |
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