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甘蓝型油菜HD-ZIP基因家族的鉴定和表达分析
引用本文:昝领兄,李开祥,贾永鹏,杜德志.甘蓝型油菜HD-ZIP基因家族的鉴定和表达分析[J].西北农业学报,2020,30(9):1351-1363.
作者姓名:昝领兄  李开祥  贾永鹏  杜德志
作者单位:(青海大学 农林科学院,青海省春油菜遗传改良重点实验室,国家油菜改良中心青海分中心,农业农村部春油菜科学观测实验站,青海省春油菜工程技术研究中心,西宁 810016)
基金项目:青海省春油菜遗传改良重点实验室项目(2017-ZJ-Y09);青海省自然科学基金(2019-ZJ-972Q)。
摘    要:为揭示HD-ZIP蛋白家族成员在甘蓝型油菜全基因组中的分布及相关特征,通过生物信息学方法共鉴定出74个HD-ZIP转录因子,分别被定位到甘蓝型油菜的19条染色体和8条随机序列;这74个HD-ZIP蛋白都含有高度保守的HD-ZIP结构域;系统发育进化树将该家族成员聚为4大类;共线性分析发现大部分基因不仅在A和C染色体组间存在共线性,而且在各自染色体组内也存在串联重复事件;基因表达分析发现,大部分HD-ZIP家族基因在根和叶中均有表达,并且在根中表达的基因多于叶片,受到盐胁迫处理时,大部分基因表达量会增加。初步明确了甘蓝型油菜HD-ZIP家族成员结构特点和相关功能,为进一步研究甘蓝型油菜HD-ZIP蛋白家族基因的生物学功能奠定了基础,为油菜抗性育种工作提供科学依据。

关 键 词:甘蓝型油菜  HD-ZIP蛋白基因家族  差异表达

Identification and Expression Analysis of HD-ZIP Gene Family in Brassica napus L.
ZAN Lingxiong,LI Kaixiang,JIA Yongpeng and DU Dezhi.Identification and Expression Analysis of HD-ZIP Gene Family in Brassica napus L.[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2020,30(9):1351-1363.
Authors:ZAN Lingxiong  LI Kaixiang  JIA Yongpeng and DU Dezhi
Abstract:
Keywords:Brassica napus L  HD-ZIP protein gene family  Differential expression
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