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中华鳖微卫星座位的分离与鉴定
引用本文:魏振邦,孙新,孙效文,鲁翠云.中华鳖微卫星座位的分离与鉴定[J].大连水产学院学报,2008,23(4).
作者姓名:魏振邦  孙新  孙效文  鲁翠云
作者单位:1. 黑龙江水产研究所,农业部北方鱼类生物工程育种莺点开放实验室,黑龙江,哈尔滨,150070;大连水产学院,生命科学与技术学院,辽宁,大连,116023
2. 黑龙江水产研究所,农业部北方鱼类生物工程育种莺点开放实验室,黑龙江,哈尔滨,150070
基金项目:科技部科技基础条件平台建设计划 
摘    要:将生物素杂交法与放射性同位素杂交法相结合,从中华鳖Trionyx sinensis基因组中分离出含有GA/CT和CA/GT重复类型的微卫星分子标记。共获得931个阳性克隆,从中选取286个进行测序,得到273个(95.45%)含有微卫星的序列,其中70.34%的重复数在10以上,55.51%为完美型。除探针中使用的CA和GA重复单元外,还观察到GC、TGTGT的重复序列。设计获得242对微卫星引物,合成40对,并对中华鳖群体遗传背景进行分析,结果表明:8对引物表现为单态,6对引物扩增带不是目的带,4对引物无扩增条带,其余22对引物扩增出多态性条带;平均等位基因数为3.48个,观测杂合度为0.1667~0.9620,期望杂合度为0.1528~0.7222,多态信息含量为0.1411—0.6800,平均多态信息含量为0.4382,大部分标记适用于中华鳖群体的遗传研究。

关 键 词:中华鳖  微卫星  生物素杂交法  放射性同位素杂交法

Isolation and characterization of microsatellite DNA Markers from softshell turtle Trionyx sinensis
WEI Zhen-bang,SUN Xin,SUN Xiao-wen,LU Cui-yun.Isolation and characterization of microsatellite DNA Markers from softshell turtle Trionyx sinensis[J].Journal of Dalian Fisheries University,2008,23(4).
Authors:WEI Zhen-bang  SUN Xin  SUN Xiao-wen  LU Cui-yun
Abstract:
Keywords:
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