| 西瓜枯萎病菌遗传多样性的相关序列扩增多态性分析 |
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| 引用本文： | 刘丽芳,肖姬玲,张 屹,朱菲莹,魏 林,梁志怀.西瓜枯萎病菌遗传多样性的相关序列扩增多态性分析[J].植物保护,2018,44(5):194-198. |
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| 作者姓名： | 刘丽芳 肖姬玲 张 屹 朱菲莹 魏 林 梁志怀 |
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| 作者单位： | 湖南大学研究生院隆平分院;湖南省农业生物技术研究所;湖南省植物保护研究所 |
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| 基金项目： | 国家公益性行业 (农业)科研专项 (201503110-03); 湖南省自然科学基金 (2016JJ2075); 湖南省现代农业蔬菜产业技术体系建设专项 |
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| 摘 要： | 对30个西瓜枯萎病菌Fusarium oxysporum f.sp.niveum菌株基因组DNA进行相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记分析,以探究其遗传多样性与地理来源的关系。采用尖孢镰刀菌西瓜专化型Fusarium oxysporumf.sp.niveum0、1、2号生理小种的基因组DNA为模板,对225对SRAP引物进行筛选,筛选出20对多态性、重复性较好且条带清晰的引物,对30个菌株进行PCR扩增,共扩增出386条带,其中多态性条带有371条,多态性比率为96.11%,平均每对引物扩增出19.3个位点和18.55个多态性位点。UPGMA法聚类分析结果显示,供试菌株两两之间的遗传相似系数范围为0.69~0.90,平均为0.79,说明尖孢镰刀菌西瓜专化型的遗传多样性较为丰富。基于SRAP标记聚类分析表明,30个菌株在遗传相似系数为0.70处被划分为3个类群,I类群包含24个菌株,其中18个来自湖南省,Ⅱ类群只包含1个来自黑龙江省哈尔滨市的菌株,它和另一个来自黑龙江地区的菌株被划分到不同的类群,且遗传距离相对较远;Ⅲ类群包含了5个菌株,其中3个来自海南三亚,其余两个来自湖南省。根据菌株的分布情况来看,菌株的聚集与地理来源没有明显的相关性。
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| 关 键 词： | 西瓜枯萎病菌 SRAP分析 遗传多样性 |
| 收稿时间： | 2017/11/16 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2018/1/8 0:00:00 |
Genetic diversity analysis of Fusarium oxysporum f.sp. niveum by sequence-related amplified polymorphism |
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| LIU Lifang,XIAO Jiling,ZHANG Yi,ZHU Feiying,WEI Lin,LIANG Zhihuai.Genetic diversity analysis of Fusarium oxysporum f.sp. niveum by sequence-related amplified polymorphism[J].Plant Protection,2018,44(5):194-198. |
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| Authors: | LIU Lifang XIAO Jiling ZHANG Yi ZHU Feiying WEI Lin LIANG Zhihuai |
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| Institution: | 1. Longping Branch, Graduate School of Hunan University, Changsha 410125, China; 2. Hunan Agricultural Biotechnology Research Institute, Changsha 410125, China; 3. Hunan Plant Protection Institute, Changsha 410125, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Fusarium oxysporum f sp niveum SRAP analysis genetic diversity |
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