猪流行性腹泻病毒贵州株M全基因遗传变异分析 |
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引用本文: | 田琴,柳晓飞,张双翔,胡兴义,张羽,田祥强,潘永,杨兰兰,王开功,周碧君,文明,程振涛.猪流行性腹泻病毒贵州株M全基因遗传变异分析[J].中国兽医杂志,2018(6). |
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作者姓名: | 田琴 柳晓飞 张双翔 胡兴义 张羽 田祥强 潘永 杨兰兰 王开功 周碧君 文明 程振涛 |
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作者单位: | 贵州大学动物科学学院;贵州省动物疫病研究室;贵州省动物疫病预防控制中心 |
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摘 要: | 为了解贵州省猪流行性腹泻病毒(PEDV)新流行毒株的遗传变异情况。本试验对贵州省2017年6月采集20份腹泻样本进行PEDV检测,并选取其2株PEDV M基因进行克隆和遗传进化分析,取名为GZFQ06-2017。结果显示,贵州省PEDV M基因与GenBank公布的26株参考序列(除韩国毒株SM98)的核苷酸相似性为94. 0%~95. 2%,与中国福建CH/FJZZ-9/201毒株和中国海南CH/HNQX-3/14毒株核苷酸相似性最低,为94. 0%,与中国江苏SQ2014毒株核苷酸相似性最高,为95. 2%;从遗传进化树可以看出,除韩国毒株SM98外,2017年6月贵州省PEDV流行毒株GZFQ06-2017与韩国疫苗株Attenuated DR13、中国江苏SQ2014和中国四川SC1402毒株同在一分支上,其亲缘关系较近,与中国湖北CH-hubei-2016和中国云南CH/YNKM-8/2013亲缘关系较远。
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