单增李斯特菌生物被膜形成不同时段sRNA的筛选 |
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引用本文: | 委慧玲,齐玉梅,张武宏,田常青,宋晨,李天昊,史文静,祁国军,魏衍全,薛惠文,苟惠天.单增李斯特菌生物被膜形成不同时段sRNA的筛选[J].畜牧与兽医,2022(4):72-79. |
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作者姓名: | 委慧玲 齐玉梅 张武宏 田常青 宋晨 李天昊 史文静 祁国军 魏衍全 薛惠文 苟惠天 |
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作者单位: | 1. 甘肃农业大学动物医学院;2. 庆阳市畜牧技术推广中心 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31960726,32060822,31560700);;国家重点研发计划项目(2019YFC1605705); |
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摘 要: | 为了筛选与单增李斯特菌(LM)生物被膜形成相关的非编码小RNA(sRNA),并初步探索sRNA及其靶基因生物学功能,本研究通过高通量测序和实时荧光定量PCR比较LM浮游菌和生物被膜形成不同时段sRNA的差异情况,筛选与LM生物被膜形成相关的sRNA;预测sRNA的靶基因及分析其可能参与生物被膜形成的调节通路。结果表明:与LM浮游菌相比,预测到38个新的sRNA,其中sRNA00085、sRNA00019、sRNA00058在LM生物被膜形成中显著上调,sRNA00054、sRNA00081、sRNA00111显著下调;3个上调sRNA和3个下调sRNA的靶基因可能参与碳代谢、不同环境中微生物代谢、核糖体、糖代谢、氨酰基-tRNA生物合成及脂肪酸代谢6条调控通路,是潜在的LM生物被膜调控因子。研究结果为深入研究LM生物被膜sRNA调控机制提供了理论依据。
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关 键 词: | 单核细胞增生李斯特菌 生物被膜 非编码小RNA 调控 |
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