| 延边牛PPARγ基因的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 张军芳,孙建富,孙斌,唐琳,王英,王恩泽,崔岩,李强,严昌国,李香子.延边牛PPARγ基因的克隆及生物信息学分析[J].中国畜牧兽医,2021,48(8):2695-2704. |
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| 作者姓名： | 张军芳 孙建富 孙斌 唐琳 王英 王恩泽 崔岩 李强 严昌国 李香子 |
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| 作者单位： | 延边大学, 东北寒区肉牛科技创新教育部工程研究中心, 延边大学肉牛科学与产业技术协同创新中心, 延吉 133002 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目（31660667） |
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| 摘 要： | 研究旨在克隆和分析延边牛过氧化物酶体增殖物激活受体γ（PPARγ）基因，并探讨其在延边牛不同组织中的表达规律。参考GenBank数据库中牛PPARγ的序列（登录号：NM_181024.2）设计引物，以18月龄延边牛为试验对象，利用RT-PCR克隆得到延边牛PPARγ基因，利用NCBI中的BLAST程序与其他物种进行相似性分析并构建系统进化树；用生物信息学软件分析其核苷酸序列及其编码蛋白的理化性质、疏水性、信号肽、跨膜结构域、亚细胞定位、磷酸化位点、糖基化位点、二级结构、三级结构等；用实时荧光定量PCR检测延边牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、小肠、皮下脂肪、肌肉8个组织中PPARγ基因的相对表达水平。结果显示，延边牛PPARγ基因CDS区序列为1 620 bp，相似性比对和系统进化树结果显示，与黄牛的亲缘关系最近，相似性为99.9%，与鸡的亲缘关系最远，相似性为82.1%；该基因编码505个氨基酸，无信号肽和跨膜结构域，为亲水性蛋白，主要分布在细胞核和细胞质中；延边牛PPARγ蛋白二级结构主要为α-螺旋和无规则卷曲，存在53个潜在的磷酸化位点，24个O-糖基化位点；实时荧光定量PCR结果显示，延边牛PPARγ基因在脾脏、皮下脂肪、肝脏中表达量显著高于心脏（P<0.05），肺脏、肾脏、肌肉和小肠中表达量显著低于心脏（P<0.05）。以上试验结果可为进一步研究PPARγ基因的功能提供借鉴。
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| 关 键 词： | PPARγ 延边牛 生物信息学分析 基因克隆 实时荧光定量PCR |
| 收稿时间： | 2020-12-28 |
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