| 利用变性梯度凝胶电泳分析正红菇菌根围土壤真菌群落多样性 |
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| 引用本文： | 肖冬来,陈丽华,陈宇航,杨菁,黄小菁.利用变性梯度凝胶电泳分析正红菇菌根围土壤真菌群落多样性[J].热带作物学报,2013,34(12):2508-2512. |
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| 作者姓名： | 肖冬来 陈丽华 陈宇航 杨菁 黄小菁 |
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| 作者单位： | 福建省农业科学院食用菌研究所;福建省农业科学院中心实验室;福建省农业科学院食用菌研究所;福建省农业科学院食用菌研究所;福建省农业科学院食用菌研究所 |
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| 基金项目： | 福建省自然科学基金项目（No. 2011J05056）；福建省农业科学院青年人才基金项目（No. 2010BS-1）。 |
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| 摘 要： | 以正红菇（Russula griseocarnosa）菌根围土壤为研究对象，通过提取土壤基因组DNA，以通用引物扩增真菌18S rRNA基因V1+V2区，将PCR产物进行变性梯度凝胶电泳（Denaturing Gradient Gel Electrophoresis），获得土壤微生物群落的DNA特征指纹图谱，并对图谱中的优势条带回收测序，通过Blast进行同源性比对并构建系统发育树，进而分析正红菇菌根围真菌群落组成及多样性。同源性比对结果表明，在回收测序的19条DGGE条带中，4条为非真菌真核生物序列，系统发育分析显示全部序列可以分为4类菌群，GroupⅠ主要为担子菌门（Basidiomycota）真菌，GroupⅡ主要为子囊菌门（Ascomycota）真菌，GroupⅢ为未知真菌，GroupⅣ主要为节肢动物门生物（Arthropoda）。
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| 关 键 词： | 正红菇 菌根围 真菌多样性 PCR变性梯度凝胶电泳 |
Analysis of Fungal Diversity of Russula griseocarnosa Mycorrhizosphere Soil with Denaturing Gradient Gel Electrophoresis |
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| XIAO Donglai,CHEN Lihu,CHEN Yuhang,YANG Jing and HUANG Xiaojing.Analysis of Fungal Diversity of Russula griseocarnosa Mycorrhizosphere Soil with Denaturing Gradient Gel Electrophoresis[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2013,34(12):2508-2512. |
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| Authors: | XIAO Donglai CHEN Lihu CHEN Yuhang YANG Jing and HUANG Xiaojing |
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| Institution: | Edible Fungi Institute, Fujian Academy of Agricultural Science;Central Laboratory, Fujian Academy of Agricultural Sciences;Edible Fungi Institute, Fujian Academy of Agricultural Science;Edible Fungi Institute, Fujian Academy of Agricultural Science;Edible Fungi Institute, Fujian Academy of Agricultural Science |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Russula griseocarnosa Mycorrhizosphere Fungal diversity PCR-DGGE |
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