| 西方蜜蜂（Apis mellifera L.）sRNA的富集与文库检测 |
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| 引用本文： | 陈璇,俞晓敏,郑火青,蔡亦梅,胡福良.西方蜜蜂（Apis mellifera L.）sRNA的富集与文库检测[J].中国农业科学,2009,42(8):2943-2948. |
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| 作者姓名： | 陈璇 俞晓敏 郑火青 蔡亦梅 胡福良 |
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| 作者单位： | 1. 浙江大学动物科学学院,杭州,310029
2. 中国科学院北京基因组研究所,基因组信息与科学重点实验室,北京,100029 |
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| 摘 要： | 【目的】提取及扩增蜜蜂（Apis mellifera L）sRNA,并构建文库检测富集结果是否满足高通量测序研究要求。【方法】取蜜蜂3个级型不同发育阶段个体作为材料,分别提取总RNA后混合,从中分离出15～40nt的sRNA,反转成cDNA后构建文库,进行蓝白斑筛选。挑选288个单克隆进行测序,对测序结果进行分析。【结果】有效序列为214条,插入的cDNA片段大小范围为15～39 bp。其中,sme-miR-71c miRNA 65条,ncRNA（包括tm-RNA、intron_ghI、5.8s rRNA）5条,tRNA 28条,siRNA及其他sRNA 33条, CDS 1条,未知序列82条。【结论】本实验采用的方法能有效富集蜜蜂sRNA,能够满足高通量测序从中识别出蜜蜂miRNA的研究。
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| 关 键 词： | 西方蜜蜂（Apis mellifera L.） sRNA富集 miRNA文库 直接克隆法 高通量测序 |
| 收稿时间： | 2008-10-21; |
Separation and Enrichment of sRNAs from Honeybee(Apis mellifera L.)and Its Quality Detection by Library Construction |
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| CHEN Xuan,YU Xiao-min,ZHENG Huo-qing,CAI Yi-mei,HU Fu-liang.Separation and Enrichment of sRNAs from Honeybee(Apis mellifera L.)and Its Quality Detection by Library Construction[J].Scientia Agricultura Sinica,2009,42(8):2943-2948. |
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| Authors: | CHEN Xuan YU Xiao-min ZHENG Huo-qing CAI Yi-mei HU Fu-liang |
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| Institution: | (Department of Special Economic Animal Science, Zhejiang University)
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| Abstract: | |
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| Keywords: | honeybee (Apis mellifera L sRNA enrichment miRNA library direct cloning method high-throughput sequencing methods |
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