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贵州黑山羊独立生长因子1B基因cDNA克隆与生物信息学分析
引用本文:陈志,罗卫星,刘若余,石照应,张依裕,蔡惠芬,谈为忠.贵州黑山羊独立生长因子1B基因cDNA克隆与生物信息学分析[J].畜牧与兽医,2012,44(7):27-32.
作者姓名:陈志  罗卫星  刘若余  石照应  张依裕  蔡惠芬  谈为忠
作者单位:1. 贵州大学动物科学学院,高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州贵阳550025
2. 苏州市吴中区金庭动物防疫站,江苏苏州,215111
基金项目:贵州省农业科技攻关项目
摘    要:选择与羊同源性较高的牛独立生长因子1B(GFI1B)基因序列设计特异性引物,提取贵州黑山羊脾脏总RNA,通过RT-PCR技术对GFI1B基因进行克隆测序及序列分析。结果表明:首次克隆了贵州黑山羊GFI1B基因cDNA序列996 bp,GenBank登录号为JN662390,编码331个氨基酸。贵州黑山羊GFI1B基因与牛的同源性高达97.0%。聚类分析显示:哺乳动物、禽类和两栖类各为一类。生物信息学分析表明:山羊GFI1B分子包括1个低组分复杂性区域、6个锌指结构域ZnF-C4。同时,预测结果还表明GFI1B分子不包含信号肽序列且没有跨膜螺旋结构域,26个磷酸化位点,蛋白糖基化位点有7个。

关 键 词:贵州黑山羊  GFI1B  克隆  序列分析

Cloning and bioinformatics analysis of GFI1B gene cDNA in the Guizhou Black Goat
CHEN Zhi , LUO Wei-xing , LIU Ruo-yu , SHI Zhao-ying , ZHANG Yi-yu , CAI Hui-fen , TAN Wei-zhong.Cloning and bioinformatics analysis of GFI1B gene cDNA in the Guizhou Black Goat[J].Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2012,44(7):27-32.
Authors:CHEN Zhi  LUO Wei-xing  LIU Ruo-yu  SHI Zhao-ying  ZHANG Yi-yu  CAI Hui-fen  TAN Wei-zhong
Institution:1.Ministry of Education Key Laboratory for Animal Genetics,Breeding and Reproduction in the Plateau Mountainous Region,College of Animal Science,Guizhou University,Guiyang 550025,China; 2.Animal Epidemic Prevention Station of Suzhou Wuzhong District,Suzhou 215111,China)
Abstract:
Keywords:Guizhou Black Goat  Growth Factor Independent 1B  Cloning  Bioinformatics  
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