奶牛瘤胃微生物元基因组文库中二肽基肽酶Ⅳ的筛选与分析 |
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引用本文: | 赵静雯,王加启,赵圣国,孙鹏,卜登攀,胡小丽,卢玉飞,王丹丹,金迪.奶牛瘤胃微生物元基因组文库中二肽基肽酶Ⅳ的筛选与分析[J].中国农业科学,2013,46(8):1687-1693. |
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作者姓名: | 赵静雯 王加启 赵圣国 孙鹏 卜登攀 胡小丽 卢玉飞 王丹丹 金迪 |
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作者单位: | 1.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所/动物营养学国家重点实验室,北京 100193
2.内蒙古民族大学动物科技学院,内蒙古通辽 028000 |
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基金项目: | 国家“973”计划项目(2011CB100804) |
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摘 要: | 【目的】研究奶牛瘤胃内参与蛋白质降解过程中二肽基肽酶Ⅳ(dipeptidyl peptidases Ⅳ,DPP-Ⅳ)的序列特征和酶学性质。【方法】从奶牛瘤胃微生物Fosmid文库中挑选17 664个克隆,利用dpp-Ⅳ简并引物筛选含dpp-Ⅳ的阳性克隆。提取阳性克隆的质粒,用限制性内切酶Hind Ⅲ进行酶切。PCR扩增含dpp-Ⅳ目的片段,并克隆测序。对阳性克隆的Fosmid末端进行测序。提取阳性克隆粗酶液,利用底物Gly-Pro-pNA检测肽酶活性。【结果】筛选后获得10个含有dpp-Ⅳ的阳性克隆(命名为DP1—DP10)。Fosmid末端序列经BLASTX比对后发现78%的序列可以与数据库的已知序列相匹配,但相似度变化较大(44%—94%)。DPP-Ⅳ序列经BioEdit比对后,发现均含有N端保守区域(DWVYEEE)和C端催化区域(GWSYGG),经BLASTP比对发现阳性克隆的DPP-Ⅳ分别与Cyclobacterium marinum(43%)、Capnocytophaga sp.(63%)、Prevotella ruminicola 23(66%)和Solitalea canadensis(50%)的DPP-Ⅳ相似度高。酶活力检测发现DP7肽酶活力最高,为6.88 U?mg-1。【结论】从瘤胃微生物Fosmid文库中获得了10个含有dpp-Ⅳ的阳性克隆,它们具有不同的dpp-Ⅳ序列特征和肽酶活性。
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关 键 词: | 瘤胃微生物 Fosmid文库 二肽基肽酶Ⅳ 末端序列 酶活性 |
收稿时间: | 2012-08-22 |
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