| 猪传染性胃肠炎病毒SC-Y株全基因组克隆及特性分析 |
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| 引用本文： | 宋振辉,郭万柱,殷华平.猪传染性胃肠炎病毒SC-Y株全基因组克隆及特性分析[J].浙江大学学报(农业与生命科学版),2007,33(2):143-149. |
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| 作者姓名： | 宋振辉 郭万柱 殷华平 |
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| 作者单位： | 四川农业大学,动物生物技术中心,四川,雅安,625014 |
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| 基金项目： | 教育部长江学者和创新团队发展计划 |
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| 摘 要： | 参考Genebank上收录的PUR46-MAD株(NC-002306)、TS株(DQ201447)和Purdue-115株(Z34093)核苷酸序列,设计并合成16对引物,应用RT-PCR技术成功地分16个片段扩增了猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)SC-Y株全长基因组序列,将这16个基因片段克隆,并测定其核苷酸序列.应用生物软件BioEdit对各测序结果进行序列拼接,确认SC-Y株基因组全长cDNA 28590 bp(GenBank收录号DQ443743),共包含7个开放阅读框.基因组5'端非编码区长315 nt,3'端非编码区长277 nt.与Miller M60株、Miller M6株和TS株相比,SC-Y株S基因缺失6个碱基.通过构建结构蛋白基因(S、sM、M和N)系统进化树,结果表明,SC-Y株可能与美国Purdue株来源于共同的祖先病毒.密码子偏爱性分析结果认为猪传染性胃肠炎病毒对以T和A结尾的密码子表现轻微的偏爱性,病毒基因表达选择酵母等真核系统可能更为合适.
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| 关 键 词： | 传染性胃肠炎病毒 全基因组 系统进化树 密码子 |
| 文章编号： | 1008-9209（2007）02-0143-07 |
| 修稿时间： | 2006-07-16 |
Cloning and analysis of genome of transmissible gastroenteritis virus SC-Y strain |
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| SONG Zhen-hui,GUO Wan-zhu,YIN Hua-ping.Cloning and analysis of genome of transmissible gastroenteritis virus SC-Y strain[J].Journal of Zhejiang University(Agriculture & Life Sciences),2007,33(2):143-149. |
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| Authors: | SONG Zhen-hui GUO Wan-zhu YIN Hua-ping |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | porcine transmissible gastroenteritis virus genome phylogenetic tree codon |
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