| 河南省猪流行性腹泻病毒流行株的遗传变异分析 |
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| 引用本文： | 黎作华,张彬,余兴龙,周绪斌.河南省猪流行性腹泻病毒流行株的遗传变异分析[J].中国兽医学报,2020(6):1073-1079. |
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| 作者姓名： | 黎作华 张彬 余兴龙 周绪斌 |
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| 作者单位： | 湖南农业大学动物科学技术学院;湖南农业大学动物医学院;天康生物股份有限公司 |
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| 基金项目： | “十三·五”国家重点研发计划资助项目(2017YFD0500101)。 |
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| 摘 要： | 为分析河南省猪流行性腹泻病毒(PEDV)S基因的遗传变异情况,设计并合成能够扩增N基因和S基因的引物,利用RT-PCR方法对2017年1月至2018年5月河南省11个地区规模猪场的178份病料进行检测、克隆和测序,并在氨基酸水平上将本研究分离株的S基因与国内外流行毒株的S基因进行比对分析。结果显示,河南省11个地区的178份样品,PEDV阳性样品113份,阳性率63.5%(113/178)。选取29株PEDV代表株进行氨基酸序列比较,结果显示,29株分离株与经典株CV777同源性为88.4%~90.3%,与经典株CV777相比,29株代表株在S1区域存在碱基的插入、缺失和变异现象;基于S基因的遗传进化分析表明,本研究的29株分离株均属于G2群,而以CV777为代表的经典株属于G1群。通过与经典株CV777的S蛋白进行抗原表位比对分析,在5~190 aa存在较大差异。本研究结果明确了目前河南省PEDV的遗传变异情况,为河南省猪流行性腹泻(PED)的诊断和防控提供参考依据。
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| 关 键 词： | 猪流行性腹泻病毒 N基因 S基因 序列分析 |
Genetic variation analysis of porcine epidemic diarrhea virus isolated from pig farm in Henan Province |
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| LI Zuo-hua,ZHANG Bin,YU Xing-long,ZHOU Xu-bin.Genetic variation analysis of porcine epidemic diarrhea virus isolated from pig farm in Henan Province[J].Chinese Journal of Veterinary Science,2020(6):1073-1079. |
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| Authors: | LI Zuo-hua ZHANG Bin YU Xing-long ZHOU Xu-bin |
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| Institution: | (College of Animal Science and Technology,Hunan Agricultural University,Changsha 410128,China;College of Veterinary Medicine,Hunan Agricultural University,Changsha 410128,China;Tecon Biology Co.,Ltd,Urumqi 830001,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | porcine epidemic diarrhea virus N gene S gene sequence analysis |
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