| 谷子TCP基因家族成员序列特征及表达模式分析 |
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| 引用本文： | 连卜颍,王喆,韩尚玲,侯思宇,韩渊怀,李红英.谷子TCP基因家族成员序列特征及表达模式分析[J].分子植物育种,2020(3):710-718. |
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| 作者姓名： | 连卜颍 王喆 韩尚玲 侯思宇 韩渊怀 李红英 |
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| 作者单位： | 山西农业大学农学院;山西农业大学;山西农业大学 |
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| 基金项目： | 山西省研究生教育创新项目(2019SY203);山西省重点研发项目(201703D211008);山西农谷项目(SXNGJSKYZX201701(-06));山西省粮食局攻关项目(201803)共同资助。 |
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| 摘 要： | 为深入解析谷子TCP基因家族的功能,通过生物信息学方法对谷子TCP转录因子家族基因成员序列特征、基因结构、染色体定位、系统进化关系及表达模式进行分析。结果表明:除第8染色体之外,从谷子基因组上其余8条染色体中共鉴定出26个TCP家族成员,并根据其在染色体的顺序和位置先后进行命名,其中分布在第3和第5染色体上的TCP家族成员数量最多,高达5个。不同家族成员其编码的氨基酸残基数目具有明显差异,范围为95 aa^451 aa。其中SiTCP21基因编码氨基酸残基数目最少为95个氨基酸;而SiTCP15最多为451个氨基酸残基。26个TCP家族成员的蛋白结构中均含有bHLH保守结构域。基因表达分析结果表明,31%的成员在穗中的表达量明显高于其他组织,因此推测该基因家族可能对谷子穗部生长发育的调控起关键作用。本研究对深入研究Si TCPs家族基因的功能奠定了基础,也为谷子生长发育的调控机制提供了新的思路。
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| 关 键 词： | 谷子(Setaria italica) TCP 转录因子 生物信息学分析 基因表达分析 |
Sequence Characteristics and Expression Patterns Analysis of TCP Gene Family Members in Foxtail Millet(Setaria italica) |
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| Lian Boying,Wang Zhe,Han Shangling,Hou Siyu,Han Yuanhuai,Li Hongying.Sequence Characteristics and Expression Patterns Analysis of TCP Gene Family Members in Foxtail Millet(Setaria italica)[J].Molecular Plant Breeding,2020(3):710-718. |
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| Authors: | Lian Boying Wang Zhe Han Shangling Hou Siyu Han Yuanhuai Li Hongying |
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| Institution: | (College of Agriculture,Shanxi Agricultural University,Taigu,030801;Institute of Agricultural Bioengineer,Shanxi Agricultural University,Taigu,030801;Shanxi Key Laboratory of Germplasm Resources Exploretion and Genetic Improvement,Shanxi Agricultural University,Taigu,030801) |
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