| 马尾松幼苗PmMADS4基因的克隆及表达分析 |
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| 引用本文： | 石长双,朱小坤,涂晶晶,吴峰.马尾松幼苗PmMADS4基因的克隆及表达分析[J].分子植物育种,2020(3):847-852. |
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| 作者姓名： | 石长双 朱小坤 涂晶晶 吴峰 |
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| 作者单位： | 贵州大学 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划课题(2017YFD0600302);国家自然科学基金(31660201);贵州省科技计划项目(黔科合LH字[2016]7447)和(黔科合平台人才[2019]5102)共同资助。 |
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| 摘 要： | MADS-box家族基因编码的转录因子,在植物、动物及微生物的发育过程中起着重要调控作用,本研究从马尾松幼苗转录组测序结果中筛选到1条具有完整开放阅读框的MADS-box基因序列,设计特异性引物并克隆获得该基因,通过生物信息学方法分析该基因的序列特征、编码蛋白的理化特性、结构域以及进化关系等,并应用荧光定量PCR技术分析该基因在马尾松幼苗不同组织中的表达活性。结果表明,克隆得到的MADS-box基因开放阅读框为672 bp,命名为Pm MADS4。Pm MADS4编码223个氨基酸,含有MADS保守域和K-box次级保守域。蛋白质理论分子量为24854.15 kD,理论等电点为7.83;其蛋白质结构主要由大量的α-螺旋(58.74%)和大量随机卷曲(31.84%)构成;亚细胞预测该基因主要在细胞核(43.5%)、线粒体(17.4%)、高尔基体(13.0%)和细胞质(13.0%)中发挥生物学作用。系统进化分析显示,Pm MADS4属于MADS-box家族基因中MIKC型的GMADS分支。组织特异性表达分析发现,Pm MADS4在马尾松幼苗的顶芽和茎中高表达,表达量分别是根部的239倍和123倍;在根部、初生叶和针叶中的表达量相对较低,表明Pm MADS4可能广泛参与马尾松幼苗地上部分分生组织的发育过程。本研究结果为Pm MADS4基因在马尾松幼苗生长发育调控方面的深入研究提供了数据基础。
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| 关 键 词： | 马尾松(Pinus massoniana) PmMADS4 基因克隆 生物信息学 基因表达 |
Cloning and Expression Analysis of PmMADS4 Gene in Pinus massoniana Seedlings |
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| Shi Changshuang,Zhu Xiaokun,Tu Jingjing,Wu Feng.Cloning and Expression Analysis of PmMADS4 Gene in Pinus massoniana Seedlings[J].Molecular Plant Breeding,2020(3):847-852. |
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| Authors: | Shi Changshuang Zhu Xiaokun Tu Jingjing Wu Feng |
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| Institution: | (Institute for Forest Resources&Environment of Guizhou,Guizhou University,Guiyang,550025) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Pinus massoniana PmMADS4 Gene cloning Bioinformatics Gene expression |
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