洋甘菊WRKY转录因子的鉴定及表达分析 |
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引用本文: | 向黎,张威威,瞿金旺,韩欢,许锋,廖咏玲.洋甘菊WRKY转录因子的鉴定及表达分析[J].分子植物育种,2020(7):2127-2137. |
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作者姓名: | 向黎 张威威 瞿金旺 韩欢 许锋 廖咏玲 |
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作者单位: | 长江大学园艺园林学院 |
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基金项目: | 湖北省高等学校创新训练项目(2017078);长江大学博士启动基金(801190010135);长江大学校科研发展基金(7011902107)共同资助。 |
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摘 要: | 为了系统分析德国洋甘菊WRKY基因家族,本研究利用生物信息学方法,从德国洋甘菊转录组共鉴定出42个WRKY转录因子,包括12个Ⅰ型基因,1个Ⅱ-a型基因,5个Ⅱ-b型基因,11个Ⅱ-c型基因,5个Ⅱ-d型基因,3个Ⅱ-e型基因和5个Ⅲ型基因。保守基序分析显示,同类型的基因拥有特异性的保守基序。表达谱数据分析表明,德国洋甘菊WRKY基因至少在一个组织中表达,并具有器官特异性。5个MrWRKY基因只在根中表达,1个MrWRKY基因只在茎和根中表达,2个MrWRKY基因只在茎和叶中表达,2个MrWRKY基因只在根和叶中表达。这一研究结果为进一步解析德国洋甘菊WRKY转录因子的功能提供了科学基础。
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关 键 词: | 转录因子 WRKY 洋甘菊(Matricaria recutita) 转录组 表达模式 |
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