| 青石斑鱼微卫星DNA 标记的筛选及群体遗传多样性分析 |
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| 引用本文： | 刘丽,刘楚吾,郭昱嵩,董秋芬,徐田军.青石斑鱼微卫星DNA 标记的筛选及群体遗传多样性分析[J].中国水产科学,2008,15(1):22-29. |
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| 作者姓名： | 刘丽 刘楚吾 郭昱嵩 董秋芬 徐田军 |
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| 作者单位： | 广东海洋大学,水产学院,广东,湛江,524025 |
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| 基金项目： | 广东省科技兴渔专项基金
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广东省湛江市988科技兴湛项目 |
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| 摘 要： | 以中国南海海域青石斑鱼（Epinephelus awoara）为材料，构建青石斑鱼小片段部分基因组DNA文库。以M13通用引物和设计合成的微卫星核心序列引物（CA）15,用PCR法对文库进行筛选，共获得96个微卫星序列，分别分布于28个阳性重组克隆中，其中perfect（完美型）共39个（占40．6％），imperfect（非完美型）30个（占31．3％），compound perfect（混合完美型）7个（占7．3％），compound imperfect（混合非完美型）20个（占20．8％）。同时发现（CA／GT）。序列在青石斑鱼的基因组DNA中含量非常丰富。根据微卫星侧翼序列设计28对引物扩增青石斑鱼基因组DNA，有26对引物能扩增出目的片段，选用其中13对多态性稳定的引物对19尾青石斑鱼进行遗传多样性分析。结果显示，13个位点共检测到48个等位基因，平均观测杂合度（Ho）为0．5982，平均期望杂合度（He）为0．5080，平均多态信息含量（PIC）为0．4722，平均Hardy-Weinberg遗传偏离指数（D）为0．1503。实验初步表明中国南海海域青石斑鱼的遗传多样性较为丰富，但在某种程度上受到了人为的干扰。
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| 关 键 词： | 青石斑鱼 基因组文库 PCR法 微卫星标记 遗传多样性 青石斑鱼 微卫星 筛选 群体 遗传多样性分析 grouper markers microsatellite DNA analysis genetic diversity population Isolation 干扰 程度 实验 指数 多态信息含量 期望 杂合度 观测 |
| 文章编号： | 1005-8737-（2008）01-0022-08 |
| 收稿时间： | 2007-03-19 |
| 修稿时间： | 2007-07-30 |
Isolation and population genetic diversity analysis of microsatellite DNA markers in yellow grouper (Epinephelus awoara) |
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| LIU Li,LIU Chu-wu,GUO Yu-song,DONG Qiu-fen,XU Tianjun.Isolation and population genetic diversity analysis of microsatellite DNA markers in yellow grouper (Epinephelus awoara)[J].Journal of Fishery Sciences of China,2008,15(1):22-29. |
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| Authors: | LIU Li LIU Chu-wu GUO Yu-song DONG Qiu-fen XU Tianjun |
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