| 叶菜型甘薯叶绿体基因组及其特征分析 |
| |
| 引用本文： | 李国良,张鸿,林赵淼,许泳清,许国春,李华伟,纪荣昌,罗文彬,邱永祥,邱思鑫,汤浩.叶菜型甘薯叶绿体基因组及其特征分析[J].西南大学学报,2023(10):43-53. |
| |
| 作者姓名： | 李国良 张鸿 林赵淼 许泳清 许国春 李华伟 纪荣昌 罗文彬 邱永祥 邱思鑫 汤浩 |
| |
| 作者单位： | 福建省农业科学院作物研究所/农业农村部南方薯类观测实验站 |
| |
| 基金项目： | 财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系项目(CARS-10-B14)； |
| |
| 摘 要： | 为探明叶菜型甘薯叶绿体基因组特征及其与番薯属植物的亲缘关系，以叶菜型甘薯‘福菜薯18号’为试验材料，利用BGISEQ-500平台和Oxford Nanopore Technologies单分子测序技术对全基因组进行建库测序，并组装其叶绿体基因组.结果显示：叶菜型甘薯叶绿体基因组全长161 387 bp,具有典型的环状四分体结构，其大单拷贝区(large single copy, LSC)、小单拷贝区(small single copy, SSC)和2个反向重复序列(inverted repeat, IR)的长度分别为87 597, 12 052和30 869 bp.注释共得到132个基因，包含87个蛋白编码基因，8个rRNA基因，37个tRNA基因.在叶菜型甘薯叶绿体基因组中共搜索到54个SSR位点，其中单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复基序个数分别为32, 4, 3, 11, 2和2个.系统进化分析表明，叶菜型甘薯与甘薯四倍体野生种Ipomoea tabascana和二倍体野生种Ipomoea trifida具有较近的亲缘关系.
|
| 关 键 词： | 叶菜型甘薯 叶绿体基因组 SSR 系统发育分析 |
|
|
