| 猪流行性腹泻病毒RT-PCR检测与ORF3基因分子流行病学调查 |
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| 引用本文： | 董彦鹏,白娟,范宝超,李玉峰,姜平.猪流行性腹泻病毒RT-PCR检测与ORF3基因分子流行病学调查[J].中国预防兽医学报,2013,35(7). |
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| 作者姓名： | 董彦鹏 白娟 范宝超 李玉峰 姜平 |
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| 作者单位： | 南京农业大学动物医学院/农业部动物细菌学重点开放实验室,江苏南京,210095 |
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| 基金项目： | 国家生猪产业体系项目，农业部公益性行业专项子课题，江苏省科技支撑计划 |
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| 摘 要： | 为调查乳仔猪腹泻引起疫情的病原,本研究自2011年2月至2012年3月收集华东地区47个规模猪场共153份腹泻病料样品,采用RT-PCR检测猪流行性腹泻病毒(PEDV),并进行ORF3基因序列分析.结果显示:26个猪场的88份样品为PEDV阳性,猪场阳性率达到55.32％,病料阳性率达到57.52％.ORF3基因测序分析显示:11个流行病毒株ORF3全基因序列大小均为675bp,编码224个氨基酸.11个流行株ORF3基因同源性为95.9％～99.9％,编码氨基酸同源性为96.4％～100％.与欧洲代表性强毒株CV777基因同源性为96.3％～97.0％,编码氨基酸同源性为95.1％～96.4％,与CV777弱毒疫苗株基因同源性为96.8％～97.6％,编码氨基酸同源性为92.3 ％～93.4％,并且无疫苗病毒株ORF3基因的49个碱基缺失.与韩国病毒株比较,其基因同源性为95.0 ％～98.5％,编码氨基酸同源性为95.5％～99.6％.基因遗传进化树分析表明,国内外PEDV株可分为4群.我国主要流行病毒株属于第1群,与韩国病毒袜亲缘关系较近,而与我国疫苗病毒株存在较大差异.该研究表明,PEDV可能是目前我国仔猪腹泻的主要病原之一,我国PEDV流行病毒株存在明显基因变异.
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| 关 键 词： | 猪流行性腹泻病毒 RT-PCR ORF3 流行病学 |
Molecular epidemiology of porcine epidemic diarrhea virus based on the ORF3 gene |
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| DONG Yan-peng
,
BAI Juan
,
FAN Bao-chao
,
LI Yu-feng
,
JIANG Ping.Molecular epidemiology of porcine epidemic diarrhea virus based on the ORF3 gene[J].Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine,2013,35(7). |
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| Authors: | DONG Yan-peng BAI Juan FAN Bao-chao LI Yu-feng JIANG Ping |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | porcine epidemic diarrhea virus RT-PCR ORF3 molecular epidemiology |
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