| 艰难拟梭菌SpoOA蛋白结构及分子特性的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 王芬,蔡其刚.艰难拟梭菌SpoOA蛋白结构及分子特性的生物信息学分析[J].青海畜牧兽医杂志,2023(3):21-26. |
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| 作者姓名： | 王芬 蔡其刚 |
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| 作者单位： | 1. 遂宁市中心医院;2. 青海大学畜牧兽医科学院 |
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| 摘 要： | 为了分析艰难拟梭菌SpoOA蛋白的结构及分子特性，本研究从NCBI蛋白质数据库中下载艰难拟梭菌SpoOA蛋白的氨基酸序列，分别采用ProtParam、Motif Scan、PSIPRED、SMART等在线分析程序预测其理化性质、翻译后修饰位点、二级结构和保守结构域，并利用MEGA 6.06软件为不同物种来源的SpoOA蛋白构建进化树。结果表明，艰难拟梭菌SpoOA蛋白序列长度为274 aa,分子量为30.85 kDa,等电点理论值为6.33,不存在信号肽及跨膜结构域，并定位于胞质中。SpoOA蛋白含有REC和SpoOA C两大结构域，二级结构由10个α螺旋和10个β折叠组成，含有6个酪蛋白激酶II磷酸化位点、1个N-肉豆蔻酰化位点和1个蛋白激酶C磷酸化位点。不同物种来源的SpoOA蛋白分为两大支，其中7种芽孢杆菌聚为一支，4种梭菌聚为另外一支。本研究运用生物信息学方法分析了艰难拟梭菌SpoOA蛋白的保守结构域及翻译后修饰位点，为进一步研究其调控毒素表达的机制提供参考。
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| 关 键 词： | 艰难拟梭菌 SpoOA 蛋白结构 分子特性 生物信息学 |
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